RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298295.3

C10orf10-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C10orf10, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf10-201ENST00000298295 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 74.5
C10orf10-201ENST00000298295 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 62.6
C10orf10-201ENST00000298295 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 50.8
C10orf10-201ENST00000298295 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.257e-25■■■■■ 46.3
C10orf10-201ENST00000298295 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.184e-10■■■■■ 42.2
C10orf10-201ENST00000298295 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 39.8
C10orf10-201ENST00000298295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.453e-7■■■■■ 38.8
C10orf10-201ENST00000298295 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.283e-12■■■■■ 32.1
C10orf10-201ENST00000298295 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 28.9
C10orf10-201ENST00000298295 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 27.3
C10orf10-201ENST00000298295 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.543e-16■■■■□ 22.9
C10orf10-201ENST00000298295 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.755e-10■■■■□ 22.5
C10orf10-201ENST00000298295 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.822e-7■■■■□ 20.6
C10orf10-201ENST00000298295 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.419e-8■■■□□ 17.3
C10orf10-201ENST00000298295 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.234e-7■■■□□ 17.2
C10orf10-201ENST00000298295 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.579e-7■■■□□ 16.2
C10orf10-201ENST00000298295 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.452e-15■■■□□ 16
C10orf10-201ENST00000298295 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.1■□□□□ 0.334e-9■■■□□ 15.3
C10orf10-201ENST00000298295 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.122e-8■■■□□ 15.3
C10orf10-201ENST00000298295 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.412e-11■■■□□ 14.6
C10orf10-201ENST00000298295 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.446e-7■■□□□ 12
C10orf10-201ENST00000298295 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.137e-6■□□□□ 11
C10orf10-201ENST00000298295 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.583e-6■□□□□ 11
C10orf10-201ENST00000298295 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.018e-7■□□□□ 10.7
C10orf10-201ENST00000298295 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.125e-8■□□□□ 9.5
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