RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CCDC78A2IDD5 438 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 HEATR9A2RTY3 570 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 A6NCN8 305 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 C2orf81A6NN90 581 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 E7EVH7 732 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TRIM38O00635 465 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SCAMP1O15126 338 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 INPP4BO15327 924 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SIGLEC6O43699 453 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 NUAK1O60285 661 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MTX2O75431 263 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PRAMEF1O95521 474 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CRTAMO95727 393 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MT-CO3P00414 261 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SLC4A1P02730 911 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CTAGE8P0CG41 777 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CKMT1AP12532 417 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 DGKAP23743 735 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MC4RP32245 332 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GATA4P43694 442 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GPR1P46091 355 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 HK3P52790 923 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CTSCP53634 463 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TMPRSS15P98073 1019 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 NFATC2Q13469 925 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SNX20Q7Z614 316 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZNF605Q86T29 641 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PARGQ86W56 976 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 NXPE1Q8N323 547 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 WDR48Q8TAF3 677 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZNF398Q8TD17 642 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 HDAC10Q969S8 669 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SNF8Q96H20 258 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 BOCQ9BWV1 1114 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 DPH1Q9BZG8 443 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 DPH5Q9H2P9 285 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PRORYQ9H606 182 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 RAD18Q9NS91 495 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 BFARQ9NZS9 450 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 VPS18Q9P253 973 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ADAMTS20P59510 1910 aa7.33□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PRSS38A1L453 326 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 AP3B1O00203 1094 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TPP1O14773 563 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MSTNO14793 375 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 EML2O95834 649 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PYGLP06737 847 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GABRB3P28472 473 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ELK3P41970 407 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 LSSP48449 732 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 LMAN1P49257 510 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GPX6P59796 221 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 RHDQ02161 417 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SEPT6Q14141 434 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PTK2BQ14289 1009 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.32□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.32□□□□□ -1.24
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