RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592444.5

ERCC1-216, Transcript of ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit, human

TSL 2

Gene ERCC1, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC1-216	ENST00000592444	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ABCA1	O95477	2261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444		E9PLN8	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ADAM10	O14672	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PSMA7	O14818	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	IRAK2	O43187	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TSPAN6	O43657	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LEFTY1	O75610	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LATS1	O95835	1130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PRNP	P04156	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	GYPC	P04921	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PGR	P06401	933 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC130	P13994	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CREB1	P16220	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	THBS2	P35442	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	MAPK9	P45984	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	EPHB1	P54762	984 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	STX17	P56962	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SOX8	P57073	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CCZ1B	P86790	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FANCC	Q00597	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	IRF4	Q15306	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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