RNA–Protein interactions for RNA: YGR083C

GCD2, Transcript of Delta subunit of the translation initiation factor eIF2B, yeast

Gene GCD2, Length 1,956 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCD2	YGR083C	YNR063W	P53749	607 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	BDF2	Q07442	638 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	RAD4	P14736	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	RRM3	P38766	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	STE5	P32917	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	AOS1	Q06624	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	INO1	P11986	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	HUL5	P53119	910 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	FAR11	P53917	953 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	SPO20	Q04359	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	GAS5	Q08193	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.61	not detected
GCD2	YGR083C	AGP1	P25376	633 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	YGR045C	P53229	120 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	RKM2	Q03942	479 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GCD2	YGR083C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
GCD2	YGR083C	ALG3	P38179	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YAR028W	P39548	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	BOI2	P39969	1040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	TIM54	P47045	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YNR014W	P53719	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	DSE4	P53753	1117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	CIT2	P08679	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	VBA5	P36172	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
GCD2	YGR083C	YBR184W	P38299	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	CNN1	P43618	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	RPN4	Q03465	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	AI1	P03875	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	ATG14	P38270	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	MPH1	P40562	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	MCM7	P38132	845 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	BUD6	P41697	788 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YFL066C	P43538	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	NCE103	P53615	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	PTC5	Q12511	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	TRK2	P28584	889 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YGL176C	P46945	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	RNH70	P53331	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	SHE9	Q04172	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	MLS1	P30952	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	BUD9	P53226	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	PPM2	Q08282	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	RKM4	Q12504	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YKL107W	P34251	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	GPT2	P36148	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	PFD1	P46988	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	TDA6	Q06466	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	THI72	Q08579	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	LAP2	Q10740	671 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	MRP8	P35719	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	MBP1	P39678	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	FMP25	Q08023	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	MDJ1	P35191	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	RGD1	P38339	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	IRR1	P40541	1150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	HNT2	P49775	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	FLC1	Q08967	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCD2	YGR083C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	NFS1	P25374	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	PRY1	P47032	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	VPS53	P47061	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	SFA1	P32771	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	HSE1	P38753	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	GPB2	P39717	880 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	AI3	P03877	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCD2	YGR083C	YER152C	P10356	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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