RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623882.3

CERS1-204, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-204ENST00000623882 CRB1P82279 1406 aa30.18■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 ABTB2Q8N961 1025 aa30.17■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 C22orf23Q9BZE7 217 aa30.17■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 GCC1Q96CN9 775 aa30.16■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 TBC1D2Q9BYX2 928 aa30.16■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.14■■■□□ 2.42
CERS1-204ENST00000623882 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.14■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.13■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 SLC4A2P04920 1241 aa30.13■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 HOXC9P31274 260 aa30.13■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa30.12■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 RGS12O14924 1447 aa30.12■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 KDRP35968 1356 aa30.12■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 KIAA0232Q92628 1395 aa30.11■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.09■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 G2E3Q7L622 706 aa30.09■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.07■■■□□ 2.41
CERS1-204ENST00000623882 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 BMP2KLQ5H9B9 411 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 MSH6P52701 1360 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 F6X3S4 739 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 MEIS3Q99687 375 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 PLEKHG5O94827 1062 aa30.04■■■□□ 2.4
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CERS1-204ENST00000623882 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.01■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 PTPRCP08575 1304 aa30.01■■■□□ 2.4
CERS1-204ENST00000623882 APBB1O00213 710 aa30.01■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 DCTPP1Q9H773 170 aa30.01■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 GNAT3A8MTJ3 354 aa30■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 ESCO1Q5FWF5 840 aa30■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 CEP85Q6P2H3 762 aa29.99■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.99■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 IL17REQ8NFR9 667 aa29.99■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 ATP10DQ9P241 1426 aa29.99■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 RTL1A6NKG5 1358 aa29.97■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 NWD1Q149M9 1564 aa29.97■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 GSE1Q14687 1217 aa29.96■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.96■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.96■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CERS1-204ENST00000623882 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
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CERS1-204ENST00000623882 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CERS1-204ENST00000623882 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-204ENST00000623882 NBPF4Q96M43 638 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-204ENST00000623882 STK31Q9BXU1 1019 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-204ENST00000623882 MAP3K5Q99683 1374 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-204ENST00000623882 ORAI2Q96SN7 254 aa29.89■■■□□ 2.38
CERS1-204ENST00000623882 IP6K1Q92551 441 aa29.88■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 FLIIQ13045 1269 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
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CERS1-204ENST00000623882 KIF2CQ99661 725 aa29.86■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.85■■■□□ 2.37
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CERS1-204ENST00000623882 TTC22Q5TAA0 569 aa29.84■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.84■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 LGR6Q9HBX8 967 aa29.84■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 LTN1O94822 1766 aa29.84■■■□□ 2.37
CERS1-204ENST00000623882 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.83■■■□□ 2.37
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CERS1-204ENST00000623882 LRRC37A3O60309 1634 aa29.82■■■□□ 2.36
CERS1-204ENST00000623882 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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CERS1-204ENST00000623882 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa29.79■■■□□ 2.36
CERS1-204ENST00000623882 GNAI2P04899 355 aa29.78■■■□□ 2.36
CERS1-204ENST00000623882 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CERS1-204ENST00000623882 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.77■■■□□ 2.36
CERS1-204ENST00000623882 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
CERS1-204ENST00000623882 KCNQ3O43525 872 aa29.76■■■□□ 2.35
CERS1-204ENST00000623882 HMMRO75330 724 aa29.76■■■□□ 2.35
CERS1-204ENST00000623882 SDSP20132 328 aa29.76■■■□□ 2.35
CERS1-204ENST00000623882 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
CERS1-204ENST00000623882 GCP02774 474 aa29.76■■■□□ 2.35
CERS1-204ENST00000623882 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.76■■■□□ 2.35
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