RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602028.5

TIMM50-218, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-218ENST00000602028 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.18■■■□□ 2.26
TIMM50-218ENST00000602028 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TIMM50-218ENST00000602028 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TIMM50-218ENST00000602028 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.16■■■□□ 2.26
TIMM50-218ENST00000602028 NBPF14Q5TI25 921 aa29.14■■■□□ 2.26
TIMM50-218ENST00000602028 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.14■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.14■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.14■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.13■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.13■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 EYA1Q99502 592 aa29.11■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.1■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.09■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 SPG7Q9UQ90 795 aa29.09■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 KCNQ2O43526 872 aa29.08■■■□□ 2.25
TIMM50-218ENST00000602028 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.07■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.07■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.07■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 BTAF1O14981 1849 aa29.06■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.05■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 TXNRD1Q16881 649 aa29.02■■■□□ 2.24
TIMM50-218ENST00000602028 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 MTHFSP49914 203 aa29■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 CYP27B1O15528 508 aa28.98■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 PROM2Q8N271 834 aa28.98■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 LRP5O75197 1615 aa28.98■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.97■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.96■■■□□ 2.23
TIMM50-218ENST00000602028 IL13P35225 146 aa28.95■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.95■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 KDRP35968 1356 aa28.95■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 STK32BQ9NY57 414 aa28.93■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 PHKG2P15735 406 aa28.9■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.9■■■□□ 2.22
TIMM50-218ENST00000602028 LY75O60449 1722 aa28.89■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 SLC15A2Q16348 729 aa28.87■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 CFAP53Q96M91 514 aa28.87■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 ITGB4P16144 1822 aa28.87■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 PAPPAQ13219 1627 aa28.87■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.86■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.85■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.84■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.84■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 DCAF5Q96JK2 942 aa28.84■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.83■■■□□ 2.21
TIMM50-218ENST00000602028 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.81■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.81■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 PALLDQ8WX93 1383 aa28.8■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 CASZ1Q86V15 1759 aa28.8■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 SPON1Q9HCB6 807 aa28.79■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 PIGBQ92521 554 aa28.78■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 PPP2R1AP30153 589 aa28.77■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 NUDCQ9Y266 331 aa28.77■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.77■■■□□ 2.2
TIMM50-218ENST00000602028 HMOX1P09601 288 aa28.75■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.75■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 AKT1S1Q96B36 256 aa28.75■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 C5P01031 1676 aa28.72■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 ZNF827Q17R98 1081 aa28.71■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.71■■■□□ 2.19
TIMM50-218ENST00000602028 CABP4P57796 275 aa28.7■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 MTFR1LQ9H019 292 aa28.7■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 RALBP1Q15311 655 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.67■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 SIK1P57059 783 aa28.67■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 KCNQ4P56696 695 aa28.66■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.66■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 ATG3Q9NT62 314 aa28.66■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.66■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.66■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.65■■■□□ 2.18
TIMM50-218ENST00000602028 ZBTB7AO95365 584 aa28.63■■■□□ 2.17
TIMM50-218ENST00000602028 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TIMM50-218ENST00000602028 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
TIMM50-218ENST00000602028 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.63■■■□□ 2.17
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