RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599722.1

MED25-208, Transcript of mediator complex subunit 25, human

TSL 3

Gene MED25, Length 504 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED25-208	ENST00000599722	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	EYA1	Q99502	592 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	EP400	Q96L91	3159 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	DISP2	A7MBM2	1401 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	NCAPD2	Q15021	1401 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	IL2RB	P14784	551 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	KDR	P35968	1356 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	EXOC5	O00471	708 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MED25-208	ENST00000599722	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	NBPF4	Q96M43	638 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	TNS2	Q63HR2	1409 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	TRIM37	O94972	964 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MED25-208	ENST00000599722	HMOX1	P09601	288 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	BAG6	P46379	1132 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	PRKAR2B	P31323	418 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	NGEF	Q8N5V2	710 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	NEFM	P07197	916 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	SBF2	Q86WG5	1849 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	MEGF6	O75095	1541 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MED25-208	ENST00000599722	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	APBA3	O96018	575 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	APAF1	O14727	1248 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.65	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	BCL9	O00512	1426 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	27.64	■■■□□ 2.02
MED25-208	ENST00000599722	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	CCDC27	Q2M243	656 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	NHS	Q6T4R5	1651 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MED25-208	ENST00000599722	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	SPG7	Q9UQ90	795 aa		27.57	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		27.56	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	RIPK4	P57078	832 aa		27.55	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.55	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		27.55	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	KCNQ2	O43526	872 aa		27.54	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		27.54	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	ZNF521	Q96K83	1311 aa		27.53	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		27.53	■■■□□ 2
MED25-208	ENST00000599722	BTAF1	O14981	1849 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	RREB1	Q92766	1687 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	WWC1	Q8IX03	1113 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	PLSCR1	O15162	318 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	CYP27B1	O15528	508 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		27.47	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
MED25-208	ENST00000599722	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.45	■■□□□ 1.98
MED25-208	ENST00000599722	PHKG2	P15735	406 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MED25-208	ENST00000599722	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
MED25-208	ENST00000599722	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98

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