RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 POLD1P28340 1107 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PP64 1363 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 TMC1Q8TDI8 760 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 IP6K1Q92551 441 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 MEGF6O75095 1541 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 NEUROD1Q13562 356 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 MSL1Q68DK7 614 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRS-208ENST00000590509 ATP10DQ9P241 1426 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 MSH5O43196 834 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 HOXC9P31274 260 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 SMIM5Q71RC9 77 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRS-208ENST00000590509 C5P01031 1676 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 GRIN3BO60391 1043 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 NBPF4Q96M43 638 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 ADCY9O60503 1353 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 USP47Q96K76 1375 aa22.78■■□□□ 1.24
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PTPRS-208ENST00000590509 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRS-208ENST00000590509 AMPHP49418 695 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 COG3Q96JB2 828 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 TESK2Q96S53 571 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 C4BP0C0L5 1744 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 HSPA6P17066 643 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 ITGB4P16144 1822 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 PALLDQ8WX93 1383 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRS-208ENST00000590509 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 CYP27B1O15528 508 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 KIF3CO14782 793 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 FYB1O15117 783 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 PHF14O94880 888 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 RTL1A6NKG5 1358 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRS-208ENST00000590509 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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PTPRS-208ENST00000590509 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 AK7Q96M32 723 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 INSRP06213 1382 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 ITPK1Q13572 414 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRS-208ENST00000590509 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 NCAPD2Q15021 1401 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 FLT4P35916 1363 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 SIK1P57059 783 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 SSFA2P28290 1259 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRS-208ENST00000590509 GNPATO15228 680 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 MMP10P09238 476 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 TONSLQ96HA7 1378 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0G2JLW4 131 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 HTRA3P83110 453 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 ATG3Q9NT62 314 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 ATP6V1AP38606 617 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 BCS1LQ9Y276 419 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.46■■□□□ 1.19
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