RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 NOD1Q9Y239 953 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM50Q86XT4 487 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 SMARCA2P51531 1590 aa6.4□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 PRMT3O60678 531 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP1A2P50993 1020 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF2IP78347 998 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF511Q8NB15 262 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 TCF3P15923 654 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ECM1Q16610 540 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC01559Q495D7 138 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 IL21Q9HBE4 155 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 SFI1A8K8P3 1242 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ICMTO60725 284 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ABL1P00519 1130 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC13P55735 322 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC102BQ68D86 513 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 S1PR4O95977 384 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 VAMP1P23763 118 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 SH3BP2P78314 561 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BRB1 525 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF20Q5VTR2 975 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R2N6 131 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 WEE1P30291 646 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.34□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 LGR5O75473 907 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK1P28482 360 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 SCTRP47872 440 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 SKOR1P84550 965 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 USP4Q13107 963 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB16Q96NS5 453 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPT3Q9UH03 358 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 C21orf2O43822 256 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf37Q96NL8 207 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 RECKO95980 971 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP4P98171 946 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 AGERQ15109 404 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC125Q86Z20 511 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.46e-6■■■■■ 47.7
CAPNS1-210ENST00000590211 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 HINFPQ9BQA5 517 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPN5P54829 565 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR3Q13615 1198 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 COL19A1Q14993 1142 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 DRC1Q96MC2 740 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF358Q9NW07 568 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-210ENST00000590211 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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