RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.18■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 PLSCR1O15162 318 aa27.17■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.17■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNQ2O43526 872 aa27.16■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 EYA1Q99502 592 aa27.16■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.16■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.14■■□□□ 1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.13■■□□□ 1.93
EFTUD2-217ENST00000590124 BTAF1O14981 1849 aa27.11■■□□□ 1.93
EFTUD2-217ENST00000590124 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
EFTUD2-217ENST00000590124 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.1■■□□□ 1.93
EFTUD2-217ENST00000590124 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.09■■□□□ 1.93
EFTUD2-217ENST00000590124 PROM2Q8N271 834 aa27.07■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.07■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.07■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP27B1O15528 508 aa27.04■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 MTHFSP49914 203 aa27.04■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.04■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.04■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.922e-6■■□□□ 11.9
EFTUD2-217ENST00000590124 IL13P35225 146 aa27.02■■□□□ 1.92
EFTUD2-217ENST00000590124 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 TXNRD1Q16881 649 aa27.01■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 SPG7Q9UQ90 795 aa27■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 NBPF14Q5TI25 921 aa26.99■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 KDRP35968 1356 aa26.97■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.96■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 PAPPAQ13219 1627 aa26.95■■□□□ 1.91
EFTUD2-217ENST00000590124 LY75O60449 1722 aa26.95■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 ITGB4P16144 1822 aa26.95■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 LRP5O75197 1615 aa26.94■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 PHKG2P15735 406 aa26.93■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.93■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.91■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.9■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
EFTUD2-217ENST00000590124 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.88■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.88■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 CASZ1Q86V15 1759 aa26.87■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.86■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP2R1AP30153 589 aa26.85■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC15A2Q16348 729 aa26.85■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 STK32BQ9NY57 414 aa26.85■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 PIGBQ92521 554 aa26.84■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.84■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 HMOX1P09601 288 aa26.83■■□□□ 1.89
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNQ4P56696 695 aa26.81■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 DCAF5Q96JK2 942 aa26.81■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 PALLDQ8WX93 1383 aa26.81■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF827Q17R98 1081 aa26.8■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 AKT1S1Q96B36 256 aa26.79■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 CFAP53Q96M91 514 aa26.79■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.79■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.79■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.77■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.77■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.76■■□□□ 1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 C5P01031 1676 aa26.76■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.76■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.76■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.73■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.73■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ATG3Q9NT62 314 aa26.72■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.72■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SPON1Q9HCB6 807 aa26.71■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 NUDCQ9Y266 331 aa26.69■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.68■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.68■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 SIK1P57059 783 aa26.68■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 CABP4P57796 275 aa26.68■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.68■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.68■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 C4BP0C0L5 1744 aa26.68■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 ZBTB7AO95365 584 aa26.67■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.67■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 MRC1P22897 1456 aa26.67■■□□□ 1.86
EFTUD2-217ENST00000590124 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms