RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 SBF2Q86WG5 1849 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 DISP2A7MBM2 1401 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC37A3O60309 1634 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 APBA3O96018 575 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 BAG6P46379 1132 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNQ2O43526 872 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R1AP30153 589 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 IL13P35225 146 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 MEGF6O75095 1541 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCB7O75027 752 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 TNS2Q63HR2 1409 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 HMOX1P09601 288 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP53Q96M91 514 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 SPG7Q9UQ90 795 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP27B1O15528 508 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 EP400Q96L91 3159 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 RALBP1Q15311 655 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 8.8
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDCQ9Y266 331 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 NCAPD2Q15021 1401 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PLSCR1O15162 318 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PHKG2P15735 406 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL9O00512 1426 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 BTAF1O14981 1849 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGB4P16144 1822 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 NHSQ6T4R5 1651 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PROM2Q8N271 834 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 TXNRD1Q16881 649 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNQ4P56696 695 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF14Q5TI25 921 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 KDRP35968 1356 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-211ENST00000588374 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKAR2BP31323 418 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 PIGBQ92521 554 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 DCAF5Q96JK2 942 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 LGR6Q9HBX8 967 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 RREB1Q92766 1687 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 FCHSD2O94868 740 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 CABP4P57796 275 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms