RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
SMAD2-208	ENST00000587269	INSR	P06213	1382 aa		40.72	■■■■■ 4.11
SMAD2-208	ENST00000587269	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SMAD2-208	ENST00000587269	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC15A2	Q16348	729 aa		40.67	■■■■■ 4.1
SMAD2-208	ENST00000587269	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SMAD2-208	ENST00000587269	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
SMAD2-208	ENST00000587269	BTAF1	O14981	1849 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SMAD2-208	ENST00000587269	MEGF6	O75095	1541 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SMAD2-208	ENST00000587269	ZBTB7A	O95365	584 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SMAD2-208	ENST00000587269	PANK3	Q9H999	370 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SMAD2-208	ENST00000587269	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SMAD2-208	ENST00000587269	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
SMAD2-208	ENST00000587269	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SMAD2-208	ENST00000587269	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SMAD2-208	ENST00000587269	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SMAD2-208	ENST00000587269	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SMAD2-208	ENST00000587269	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
SMAD2-208	ENST00000587269	POLK	Q9UBT6	870 aa		40.5	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	CASZ1	Q86V15	1759 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	MTFR1L	Q9H019	292 aa		40.46	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	SPG7	Q9UQ90	795 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SMAD2-208	ENST00000587269	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SMAD2-208	ENST00000587269	EYA1	Q99502	592 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF827	Q17R98	1081 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SMAD2-208	ENST00000587269	MORC1	Q86VD1	984 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SMAD2-208	ENST00000587269	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
SMAD2-208	ENST00000587269	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SMAD2-208	ENST00000587269	NSD2	O96028	1365 aa		40.39	■■■■■ 4.06
SMAD2-208	ENST00000587269	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	KCNQ4	P56696	695 aa		40.38	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		40.38	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		40.37	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	CYP27B1	O15528	508 aa		40.37	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	AKT1S1	Q96B36	256 aa		40.37	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	PTGER2	P43116	358 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	PAPPA	Q13219	1627 aa		40.34	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
SMAD2-208	ENST00000587269	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	40.32	■■■■■ 4.05	7e-8	■■■■□ 19.6
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		40.31	■■■■■ 4.04
SMAD2-208	ENST00000587269	NCAPD2	Q15021	1401 aa		40.28	■■■■■ 4.04
SMAD2-208	ENST00000587269	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
SMAD2-208	ENST00000587269	MSH5	O43196	834 aa		40.27	■■■■■ 4.04
SMAD2-208	ENST00000587269	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		40.27	■■■■■ 4.04
SMAD2-208	ENST00000587269	LY75	O60449	1722 aa		40.27	■■■■■ 4.04
SMAD2-208	ENST00000587269	ARX	Q96QS3	562 aa		40.26	■■■■■ 4.04
SMAD2-208	ENST00000587269	POLD1	P28340	1107 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		40.24	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		40.24	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	PALLD	Q8WX93	1383 aa		40.23	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	40.23	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		40.21	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		40.21	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	SYT17	Q9BSW7	474 aa		40.2	■■■■■ 4.03
SMAD2-208	ENST00000587269	PHKG2	P15735	406 aa		40.19	■■■■■ 4.02
SMAD2-208	ENST00000587269	PIGB	Q92521	554 aa		40.19	■■■■■ 4.02
SMAD2-208	ENST00000587269	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		40.17	■■■■■ 4.02
SMAD2-208	ENST00000587269	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
SMAD2-208	ENST00000587269	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		40.15	■■■■■ 4.02
SMAD2-208	ENST00000587269	ITGB4	P16144	1822 aa		40.14	■■■■■ 4.02
SMAD2-208	ENST00000587269	KLHL34	Q8N239	644 aa		40.14	■■■■■ 4.02
SMAD2-208	ENST00000587269	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	YY1	P25490	414 aa		40.13	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		40.12	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	40.12	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		40.12	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		40.11	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	AK7	Q96M32	723 aa		40.1	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		40.09	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	40.09	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
SMAD2-208	ENST00000587269	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		40.06	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	C5	P01031	1676 aa		40.05	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		40.05	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	SIK1	P57059	783 aa		40.05	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		40.05	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		40.05	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	DCAF5	Q96JK2	942 aa		40.05	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		40.04	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		40.03	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	MTHFS	P49914	203 aa		40.01	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		40.01	■■■■■ 4
SMAD2-208	ENST00000587269	IL13	P35225	146 aa		40	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	ATP6V1A	P38606	617 aa		40	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	MAP3K5	Q99683	1374 aa		39.99	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	39.98	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	CABP4	P57796	275 aa		39.98	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	MSL1	Q68DK7	614 aa		39.98	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		39.98	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	ATG3	Q9NT62	314 aa		39.97	■■■■□ 3.99
SMAD2-208	ENST00000587269	PHF14	O94880	888 aa		39.96	■■■■□ 3.99

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms