RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580004.1

NEK4P2-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 2, humanhuman

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Gene NEK4P2, Length 1,012 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P2-201ENST00000580004 NHSQ6T4R5 1651 aa25.31■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.31■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 MTHFSP49914 203 aa25.3■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.27■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.27■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.27■■□□□ 1.64
NEK4P2-201ENST00000580004 APBA3O96018 575 aa25.26■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 KDRP35968 1356 aa25.24■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 IL13P35225 146 aa25.24■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 RREB1Q92766 1687 aa25.23■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 PLSCR1O15162 318 aa25.23■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 SPG7Q9UQ90 795 aa25.23■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.23■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.22■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.2■■□□□ 1.63
NEK4P2-201ENST00000580004 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 BTAF1O14981 1849 aa25.19■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 CFAP53Q96M91 514 aa25.18■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 PPP2R1AP30153 589 aa25.17■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.17■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 CYP27B1O15528 508 aa25.16■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.15■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 KCNQ2O43526 872 aa25.14■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.14■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.14■■□□□ 1.62
NEK4P2-201ENST00000580004 RALBP1Q15311 655 aa25.13■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.13■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.12■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.11■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 ITGB4P16144 1822 aa25.11■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.1■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 PHKG2P15735 406 aa25.1■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 NUDCQ9Y266 331 aa25.09■■□□□ 1.61
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 LY75O60449 1722 aa25.06■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 NBPF14Q5TI25 921 aa25.06■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 TXNRD1Q16881 649 aa25.05■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 DCAF5Q96JK2 942 aa25.04■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 HMOX1P09601 288 aa25.03■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.03■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 PROM2Q8N271 834 aa25.03■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.02■■□□□ 1.6
NEK4P2-201ENST00000580004 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.01■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.01■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 PAPPAQ13219 1627 aa24.99■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.99■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 FCHSD2O94868 740 aa24.98■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.98■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.98■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.97■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.96■■□□□ 1.59
NEK4P2-201ENST00000580004 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.95■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 PIGBQ92521 554 aa24.95■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 PALLDQ8WX93 1383 aa24.93■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.92■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 PRKAR2BP31323 418 aa24.92■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 STK32BQ9NY57 414 aa24.92■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.92■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 MRC1P22897 1456 aa24.91■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.91■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.91■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 CABP4P57796 275 aa24.9■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC15A2Q16348 729 aa24.9■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 C5P01031 1676 aa24.9■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NEK4P2-201ENST00000580004 LRP5O75197 1615 aa24.89■■□□□ 1.57
NEK4P2-201ENST00000580004 MAP3K5Q99683 1374 aa24.88■■□□□ 1.57
NEK4P2-201ENST00000580004 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.87■■□□□ 1.57
NEK4P2-201ENST00000580004 CASZ1Q86V15 1759 aa24.87■■□□□ 1.57
NEK4P2-201ENST00000580004 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.87■■□□□ 1.57
NEK4P2-201ENST00000580004 NEFMP07197 916 aa24.86■■□□□ 1.57
NEK4P2-201ENST00000580004 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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