RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHL1O00533 1208 aa37.43■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 MS4A1P11836 297 aa37.43■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL18A1P39060 1754 aa37.42■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNAT3A8MTJ3 354 aa37.42■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 AXIN2Q9Y2T1 843 aa37.42■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAP3K5Q99683 1374 aa37.4■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC37A3O60309 1634 aa37.4■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPDO75976 1380 aa37.39■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 VAMP4O75379 141 aa37.39■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERBB3P21860 1342 aa37.39■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF16BQ96L93 1317 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 CABLES1Q8TDN4 633 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMO7Q8WWI1 1683 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 AAMPQ13685 434 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 PANK1Q8TE04 598 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0232Q92628 1395 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 AMOTQ4VCS5 1084 aa37.33■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPYL6Q8N831 410 aa37.33■■■■□ 3.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.32■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 C8orf58Q8NAV2 365 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 COG6Q9Y2V7 657 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa37.29■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 BABAM1Q9NWV8 329 aa37.29■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCA3Q99758 1704 aa37.27■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPYL4Q9UJ04 414 aa37.27■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 RLBP1P12271 317 aa37.26■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL17REQ8NFR9 667 aa37.26■■■■□ 3.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM27P14373 513 aa37.25■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKAP4Q5JQC9 854 aa37.25■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNNQ9UQP3 1299 aa37.24■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLUAP1Q96AJ1 413 aa37.24■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa37.24■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP45Q92619 1136 aa37.23■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa37.22■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 MVPQ14764 893 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRNA2Q15822 529 aa37.22■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 NLRP2Q9NX02 1062 aa37.22■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa37.2■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa37.2■■■■□ 3.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa37.19■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf141Q5JVX7 400 aa37.18■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa37.18■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.18■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 KDM2BQ8NHM5 1336 aa37.18■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIS18AQ9NYP9 233 aa37.17■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa37.17■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX19BQ9UMR2 479 aa37.15■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 TATP17735 454 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT24Q2M2I5 525 aa37.13■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP37.12■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 LGR6Q9HBX8 967 aa37.09■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITPRIPQ8IWB1 547 aa37.08■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR17Q8IZU2 1322 aa37.08■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNMTO43148 476 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM57Q8N5G2 664 aa37.07■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPG7Q9UQ90 795 aa37.07■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa37.07■■■■□ 3.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 KDM3BQ7LBC6 1761 aa37.07■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEFQ10587 303 aa37.07■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MEGF6O75095 1541 aa37.05■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa37.05■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 PKD1L3Q7Z443 1732 aa37.03■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCC4O15439 1325 aa37.02■■■■□ 3.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPRCP08575 1304 aa37.01■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 CACNA1FO60840 1977 aa36.99■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.99■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCN11AQ9UI33 1791 aa36.97■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTBD11A6QL63 1104 aa36.97■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC30Q5VVM6 783 aa36.97■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa36.97■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.96■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHMP4AQ9BY43 222 aa36.96■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGHDP01880 384 aa36.96■■■■□ 3.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC4A2P04920 1241 aa36.96■■■■□ 3.51
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