RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 NSD2O96028 1365 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 TXNRD1Q16881 649 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 EYA1Q99502 592 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 NHSQ6T4R5 1651 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 STK32BQ9NY57 414 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYP27B1O15528 508 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 NCAPD2Q15021 1401 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPG7Q9UQ90 795 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNQ4P56696 695 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 BTAF1O14981 1849 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRP5O75197 1615 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC15A2Q16348 729 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTHFSP49914 203 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB7AO95365 584 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF827Q17R98 1081 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPON1Q9HCB6 807 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHKG2P15735 406 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL13P35225 146 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIGBQ92521 554 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 AKT1S1Q96B36 256 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 PAPPAQ13219 1627 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 PALLDQ8WX93 1383 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMOX1P09601 288 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 CASZ1Q86V15 1759 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTFR1LQ9H019 292 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDRP35968 1356 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTGER2P43116 358 aa24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCAF5Q96JK2 942 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 LY75O60449 1722 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 MSH5O43196 834 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATG3Q9NT62 314 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIK1P57059 783 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 CABP4P57796 275 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITGB4P16144 1822 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPP2R1AP30153 589 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP6V1AP38606 617 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 SMIM5Q71RC9 77 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 AK7Q96M32 723 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFAP53Q96M91 514 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITPK1Q13572 414 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHF14O94880 888 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDNEP1-207ENST00000572043 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.91■■□□□ 1.42
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