RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 VAMP4O75379 141 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 RLBP1P12271 317 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 CHL1O00533 1208 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF428Q96B54 188 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 MAP3K5Q99683 1374 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 NCAPD2Q15021 1401 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 ERBB3P21860 1342 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 KIF16BQ96L93 1317 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 COL18A1P39060 1754 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 LRRC37A3O60309 1634 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-212ENST00000568900 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM27P14373 513 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 MS4A1P11836 297 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 CHRNA2Q15822 529 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA0232Q92628 1395 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 KRT24Q2M2I5 525 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 IL17REQ8NFR9 667 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 CPDO75976 1380 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
SPNS1-212ENST00000568900 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC6O95255 1503 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 ABCA3Q99758 1704 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 AAMPQ13685 434 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-212ENST00000568900 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 LGR6Q9HBX8 967 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 IGHDP01880 384 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 SKAP1Q86WV1 359 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS1-212ENST00000568900 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 MEGF6O75095 1541 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 TEFQ10587 303 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC4O15439 1325 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 SLC4A2P04920 1241 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 SPG7Q9UQ90 795 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-212ENST00000568900 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 BTBD11A6QL63 1104 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 NECTIN2Q92692 538 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 STK31Q9BXU1 1019 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 PTPRCP08575 1304 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 RGS12O14924 1447 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 KCNQ3O43525 872 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-212ENST00000568900 PHKG2P15735 406 aa26.47■■□□□ 1.83
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