RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568810.5

PPP4C-213, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,080 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-213	ENST00000568810	TXNRD1	Q16881	649 aa		34.15	■■■■□ 3.06
PPP4C-213	ENST00000568810	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
PPP4C-213	ENST00000568810	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		34.14	■■■■□ 3.06
PPP4C-213	ENST00000568810	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PPP4C-213	ENST00000568810	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PPP4C-213	ENST00000568810	NSD2	O96028	1365 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PPP4C-213	ENST00000568810	BTAF1	O14981	1849 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PPP4C-213	ENST00000568810	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	34.11	■■■■□ 3.05
PPP4C-213	ENST00000568810	POLK	Q9UBT6	870 aa		34.11	■■■■□ 3.05
PPP4C-213	ENST00000568810	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	34.1	■■■■□ 3.05
PPP4C-213	ENST00000568810	NCAPD2	Q15021	1401 aa		34.07	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	34.06	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	STK32B	Q9NY57	414 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	34.02	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	34.02	■■■■□ 3.04
PPP4C-213	ENST00000568810	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	EYA1	Q99502	592 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PPP4C-213	ENST00000568810	CYP27B1	O15528	508 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PPP4C-213	ENST00000568810	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PPP4C-213	ENST00000568810	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.92	■■■■□ 3.02
PPP4C-213	ENST00000568810	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PPP4C-213	ENST00000568810	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.91	■■■■□ 3.02
PPP4C-213	ENST00000568810	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PPP4C-213	ENST00000568810	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.89	■■■■□ 3.02
PPP4C-213	ENST00000568810	LY75	O60449	1722 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PPP4C-213	ENST00000568810	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.84	■■■■□ 3.01
PPP4C-213	ENST00000568810	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.84	■■■■□ 3.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-213	ENST00000568810	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.82	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.8	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	ITGB4	P16144	1822 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	KCNQ4	P56696	695 aa		33.78	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	PHKG2	P15735	406 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4C-213	ENST00000568810	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	PTGER2	P43116	358 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	PIGB	Q92521	554 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	IL13	P35225	146 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	MTHFS	P49914	203 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-213	ENST00000568810	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	KDR	P35968	1356 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	C5	P01031	1676 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PPP4C-213	ENST00000568810	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-213	ENST00000568810	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PPP4C-213	ENST00000568810	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-213	ENST00000568810	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-213	ENST00000568810	SIK1	P57059	783 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-213	ENST00000568810	ARX	Q96QS3	562 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-213	ENST00000568810	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-213	ENST00000568810	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	POLD1	P28340	1107 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	MSH5	O43196	834 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	AK7	Q96M32	723 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP4C-213	ENST00000568810	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.51	■■■□□ 2.96

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