RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RREB1	Q92766	1687 aa		12.89	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.89	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.88	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		12.88	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	MEGF6	O75095	1541 aa		12.88	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12.87	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	EYA1	Q99502	592 aa		12.87	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		12.87	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	LRP5	O75197	1615 aa		12.87	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		12.87	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		12.87	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.86	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.86	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	NSD2	O96028	1365 aa		12.85	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		12.85	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	NHS	Q6T4R5	1651 aa		12.85	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.85	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP27B1	O15528	508 aa		12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB7A	O95365	584 aa		12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNQ4	P56696	695 aa		12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	NCAPD2	Q15021	1401 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	BTAF1	O14981	1849 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	PHKG2	P15735	406 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	PTGER2	P43116	358 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	PIGB	Q92521	554 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-231	ENST00000567479	MTHFS	P49914	203 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	IL13	P35225	146 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	MSH5	O43196	834 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	ARX	Q96QS3	562 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAF5	Q96JK2	942 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	SYT17	Q9BSW7	474 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	POLD1	P28340	1107 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		12.72	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	SIK1	P57059	783 aa		12.72	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	CABP4	P57796	275 aa		12.72	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		12.72	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.72	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP6V1A	P38606	617 aa		12.71	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	AK7	Q96M32	723 aa		12.71	□□□□□ -0.37
KIFC3-231	ENST00000567479	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		12.71	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.7	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	HMOX1	P09601	288 aa		12.7	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	LY75	O60449	1722 aa		12.69	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	KDR	P35968	1356 aa		12.69	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	ITPK1	Q13572	414 aa		12.68	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		12.68	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL34	Q8N239	644 aa		12.68	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		12.68	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		12.68	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
KIFC3-231	ENST00000567479	PHF14	O94880	888 aa		12.67	□□□□□ -0.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms