RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.99■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL13P35225 146 aa29.96■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NHSQ6T4R5 1651 aa29.95■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.95■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.95■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.94■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.94■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP2R1AP30153 589 aa29.92■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDRP35968 1356 aa29.9■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APBA3O96018 575 aa29.9■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP53Q96M91 514 aa29.89■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPG7Q9UQ90 795 aa29.89■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.89■■■□□ 2.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.88■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.86■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.86■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.85■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP27B1O15528 508 aa29.84■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RALBP1Q15311 655 aa29.84■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.83■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.83■■■□□ 2.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RREB1Q92766 1687 aa29.82■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNQ2O43526 872 aa29.82■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BTAF1O14981 1849 aa29.81■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLSCR1O15162 318 aa29.8■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.8■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.78■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.78■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.77■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMOX1P09601 288 aa29.77■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHKG2P15735 406 aa29.77■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUDCQ9Y266 331 aa29.77■■■□□ 2.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.75■■■□□ 2.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGB4P16144 1822 aa29.7■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.69■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF5Q96JK2 942 aa29.66■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TXNRD1Q16881 649 aa29.65■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.65■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LY75O60449 1722 aa29.64■■■□□ 2.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.63■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.63■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PROM2Q8N271 834 aa29.63■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRKAR2BP31323 418 aa29.62■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.61■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FCHSD2O94868 740 aa29.61■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.6■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.59■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.59■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIGBQ92521 554 aa29.59■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAPPAQ13219 1627 aa29.58■■■□□ 2.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa29.57■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PALLDQ8WX93 1383 aa29.57■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRC1P22897 1456 aa29.54■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K5Q99683 1374 aa29.53■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CABP4P57796 275 aa29.53■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.53■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.52■■■□□ 2.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEFMP07197 916 aa29.5■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.49■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STK32BQ9NY57 414 aa29.49■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANP32CO43423 234 aa29.47■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LGR6Q9HBX8 967 aa29.47■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATG3Q9NT62 314 aa29.47■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.47■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C5P01031 1676 aa29.47■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.46■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.46■■■□□ 2.31
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