RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 NCAPD2Q15021 1401 aa25.29■■□□□ 1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNQ2O43526 872 aa25.28■■□□□ 1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.28■■□□□ 1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 MTHFSP49914 203 aa25.27■■□□□ 1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.24■■□□□ 1.63
GCSHP2-201ENST00000560971 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.23■■□□□ 1.63
GCSHP2-201ENST00000560971 IL13P35225 146 aa25.21■■□□□ 1.63
GCSHP2-201ENST00000560971 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.19■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.19■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.19■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 NHSQ6T4R5 1651 aa25.19■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 PLSCR1O15162 318 aa25.18■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP27B1O15528 508 aa25.18■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.18■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 SPG7Q9UQ90 795 aa25.16■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.15■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.15■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 PROM2Q8N271 834 aa25.14■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
GCSHP2-201ENST00000560971 RREB1Q92766 1687 aa25.13■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.12■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP2R1AP30153 589 aa25.12■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.11■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 BTAF1O14981 1849 aa25.1■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.1■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 TXNRD1Q16881 649 aa25.1■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.1■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 KDRP35968 1356 aa25.09■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 HMOX1P09601 288 aa25.09■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 PHKG2P15735 406 aa25.09■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.09■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.07■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.06■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF14Q5TI25 921 aa25.06■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.05■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP53Q96M91 514 aa25.05■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.04■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.03■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.01■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNQ4P56696 695 aa24.99■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 PIGBQ92521 554 aa24.99■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.97■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF5Q96JK2 942 aa24.97■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGB4P16144 1822 aa24.96■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.96■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.96■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 RALBP1Q15311 655 aa24.95■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 NUDCQ9Y266 331 aa24.95■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 STK32BQ9NY57 414 aa24.94■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 PALLDQ8WX93 1383 aa24.93■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.93■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC15A2Q16348 729 aa24.93■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 LY75O60449 1722 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 PAPPAQ13219 1627 aa24.91■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF827Q17R98 1081 aa24.91■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.91■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.91■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 PRKAR2BP31323 418 aa24.9■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 CABP4P57796 275 aa24.89■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.89■■□□□ 1.58
GCSHP2-201ENST00000560971 AKT1S1Q96B36 256 aa24.88■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 LGR6Q9HBX8 967 aa24.88■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 ATG3Q9NT62 314 aa24.88■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.86■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 FCHSD2O94868 740 aa24.85■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.83■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 SIK1P57059 783 aa24.83■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.83■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.82■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 CASZ1Q86V15 1759 aa24.81■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.81■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.81■■□□□ 1.56
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