RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa44.59■■■■■ 4.73
TTC7B-202ENST00000553948 SHANK3Q9BYB0 1731 aa44.58■■■■■ 4.73
TTC7B-202ENST00000553948 STK32BQ9NY57 414 aa44.57■■■■■ 4.73
TTC7B-202ENST00000553948 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 SPON1Q9HCB6 807 aa44.56■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa44.55■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 TATP17735 454 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 CASZ1Q86V15 1759 aa44.52■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 DOT1LQ8TEK3 1739 aa44.51■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 SLC15A2Q16348 729 aa44.51■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 PANK3Q9H999 370 aa44.51■■■■■ 4.72
TTC7B-202ENST00000553948 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
TTC7B-202ENST00000553948 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
TTC7B-202ENST00000553948 WASHC2AQ641Q2 1341 aa44.48■■■■■ 4.71
TTC7B-202ENST00000553948 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
TTC7B-202ENST00000553948 POLKQ9UBT6 870 aa44.45■■■■■ 4.71
TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 PAPPAQ13219 1627 aa44.42■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa44.41■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa44.41■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC4BQ9NT99 713 aa44.4■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 SLC27A3Q5K4L6 730 aa44.39■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 NSD2O96028 1365 aa44.39■■■■■ 4.7
TTC7B-202ENST00000553948 NCAPD2Q15021 1401 aa44.38■■■■■ 4.69
TTC7B-202ENST00000553948 ZBTB7AO95365 584 aa44.37■■■■■ 4.69
TTC7B-202ENST00000553948 EYA1Q99502 592 aa44.33■■■■■ 4.69
TTC7B-202ENST00000553948 PKD1L3Q7Z443 1732 aa44.32■■■■■ 4.69
TTC7B-202ENST00000553948 LY75O60449 1722 aa44.3■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF827Q17R98 1081 aa44.3■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 CYP27B1O15528 508 aa44.29■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP44.29■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 KNSTRNQ9Y448 316 aa44.28■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 SPG7Q9UQ90 795 aa44.27■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 MORC1Q86VD1 984 aa44.26■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 MTFR1LQ9H019 292 aa44.26■■■■■ 4.68
TTC7B-202ENST00000553948 AKT1S1Q96B36 256 aa44.25■■■■■ 4.67
TTC7B-202ENST00000553948 KIF7Q2M1P5 1343 aa44.24■■■■■ 4.67
TTC7B-202ENST00000553948 PTGER2P43116 358 aa44.24■■■■■ 4.67
TTC7B-202ENST00000553948 KCNQ4P56696 695 aa44.24■■■■■ 4.67
TTC7B-202ENST00000553948 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP44.21■■■■■ 4.67
TTC7B-202ENST00000553948 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
TTC7B-202ENST00000553948 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa44.18■■■■■ 4.66
TTC7B-202ENST00000553948 QSER1Q2KHR3 1735 aa44.18■■■■■ 4.66
TTC7B-202ENST00000553948 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa44.18■■■■■ 4.66
TTC7B-202ENST00000553948 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
TTC7B-202ENST00000553948 ITGB4P16144 1822 aa44.15■■■■■ 4.66
TTC7B-202ENST00000553948 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa44.15■■■■■ 4.66
TTC7B-202ENST00000553948 IGSF1Q8N6C5 1336 aa44.13■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 SGIP1Q9BQI5 828 aa44.11■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 PALLDQ8WX93 1383 aa44.1■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa44.1■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa44.1■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa44.1■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 IFNL2Q8IZJ0 200 aa44.09■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 SLC16A10Q8TF71 515 aa44.08■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 PHKG2P15735 406 aa44.07■■■■■ 4.65
TTC7B-202ENST00000553948 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
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TTC7B-202ENST00000553948 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
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TTC7B-202ENST00000553948 ARXQ96QS3 562 aa44.02■■■■■ 4.64
TTC7B-202ENST00000553948 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
TTC7B-202ENST00000553948 TMOD3Q9NYL9 352 aa44■■■■■ 4.63
TTC7B-202ENST00000553948 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
TTC7B-202ENST00000553948 TAF1LQ8IZX4 1826 aa43.98■■■■■ 4.63
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
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TTC7B-202ENST00000553948 MSH5O43196 834 aa43.94■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 POLD1P28340 1107 aa43.93■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 AEBP1Q8IUX7 1158 aa43.93■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 COL24A1Q17RW2 1714 aa43.93■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 AMOTQ4VCS5 1084 aa43.92■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 IL13P35225 146 aa43.91■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
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TTC7B-202ENST00000553948 SULT6B1Q6IMI4 303 aa43.89■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 C4BP0C0L5 1744 aa43.88■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 ASAP1Q9ULH1 1129 aa43.88■■■■■ 4.62
TTC7B-202ENST00000553948 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa43.87■■■■■ 4.61
TTC7B-202ENST00000553948 SIK1P57059 783 aa43.87■■■■■ 4.61
TTC7B-202ENST00000553948 DCAF5Q96JK2 942 aa43.87■■■■■ 4.61
TTC7B-202ENST00000553948 MAP3K5Q99683 1374 aa43.87■■■■■ 4.61
TTC7B-202ENST00000553948 KDRP35968 1356 aa43.85■■■■■ 4.61
TTC7B-202ENST00000553948 ERVV-2B6SEH9 535 aa43.85■■■■■ 4.61
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TTC7B-202ENST00000553948 AK7Q96M32 723 aa43.84■■■■■ 4.61
TTC7B-202ENST00000553948 ATG3Q9NT62 314 aa43.82■■■■■ 4.61
TTC7B-202ENST00000553948 C1orf141Q5JVX7 400 aa43.81■■■■■ 4.6
TTC7B-202ENST00000553948 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa43.8■■■■■ 4.6
TTC7B-202ENST00000553948 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
TTC7B-202ENST00000553948 YY1P25490 414 aa43.78■■■■■ 4.6
TTC7B-202ENST00000553948 KLHL34Q8N239 644 aa43.78■■■■■ 4.6
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