RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552958.5

AC004801.5-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 550 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-201ENST00000552958 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.94□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 PAPPAQ13219 1627 aa12.94□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.93□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC24A1O60721 1099 aa12.93□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.93□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.93□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.92□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 NSD3Q9BZ95 1437 aa12.92□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 NSD2O96028 1365 aa12.92□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 YY1P25490 414 aa12.91□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.91□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 MTFR1LQ9H019 292 aa12.91□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 RTL1A6NKG5 1358 aa12.91□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 AKT1S1Q96B36 256 aa12.9□□□□□ -0.34
AC004801.5-201ENST00000552958 CDCA8Q53HL2 280 aa12.89□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.89□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 SYT17Q9BSW7 474 aa12.89□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 INSRP06213 1382 aa12.89□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 FLT4P35916 1363 aa12.88□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa12.88□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.87□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 KLHL34Q8N239 644 aa12.87□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 ARXQ96QS3 562 aa12.87□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.87□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.86□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.86□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 CYP27B1O15528 508 aa12.86□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 LY75O60449 1722 aa12.85□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.85□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 MSH5O43196 834 aa12.84□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 SMIM5Q71RC9 77 aa12.84□□□□□ -0.35
AC004801.5-201ENST00000552958 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa12.83□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 MSL1Q68DK7 614 aa12.83□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 EYA1Q99502 592 aa12.83□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 POLKQ9UBT6 870 aa12.83□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.83□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.83□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.83□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.81□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 AMIGO3Q86WK7 504 aa12.81□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 NLGN2Q8NFZ4 835 aa12.81□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 PANK3Q9H999 370 aa12.81□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.81□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 PALLDQ8WX93 1383 aa12.81□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.8□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.8□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.8□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 PIGBQ92521 554 aa12.8□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 PKD1L3Q7Z443 1732 aa12.79□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 POLD1P28340 1107 aa12.79□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 C5P01031 1676 aa12.79□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 NCAPD2Q15021 1401 aa12.79□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 ITGB4P16144 1822 aa12.78□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 GPR162Q16538 588 aa12.78□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 UTRNP46939 3433 aa12.78□□□□□ -0.36
AC004801.5-201ENST00000552958 SPG7Q9UQ90 795 aa12.77□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 PHF14O94880 888 aa12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 PHKG2P15735 406 aa12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 MAP3K5Q99683 1374 aa12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.76□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 LINC00116Q8NCU8 138 aa12.75□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 C4BP0C0L5 1744 aa12.74□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 ITPK1Q13572 414 aa12.74□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.74□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 AK7Q96M32 723 aa12.74□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.74□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.74□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.73□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 SIK1P57059 783 aa12.73□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 MORC1Q86VD1 984 aa12.73□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.73□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 ATG3Q9NT62 314 aa12.73□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.72□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 ATP6V1AP38606 617 aa12.71□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.71□□□□□ -0.37
AC004801.5-201ENST00000552958 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
AC004801.5-201ENST00000552958 UBR3Q6ZT12 1888 aa12.7□□□□□ -0.38
AC004801.5-201ENST00000552958 KIF7Q2M1P5 1343 aa12.69□□□□□ -0.38
AC004801.5-201ENST00000552958 CHD4Q14839 1912 aa12.69□□□□□ -0.38
AC004801.5-201ENST00000552958 GNPATO15228 680 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms