RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.62■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 CRB1P82279 1406 aa23.62■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.61■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.61■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.6■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.6■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 CHL1O00533 1208 aa23.59■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.59■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 IP6K1Q92551 441 aa23.58■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF428Q96B54 188 aa23.58■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 MST1RQ04912 1400 aa23.58■■□□□ 1.37
SYTL1-208ENST00000543823 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.58■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.57■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.57■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.57■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 NBPF4Q96M43 638 aa23.57■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 RTL1A6NKG5 1358 aa23.57■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 SEC24BO95487 1268 aa23.56■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 GCP02774 474 aa23.56■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 MSH6P52701 1360 aa23.54■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.54■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 SLIT3O75094 1523 aa23.54■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 ABCC4O15439 1325 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 STRCQ7RTU9 1775 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 USP19O94966 1318 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-208ENST00000543823 ATF3P18847 181 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 SLC4A3P48751 1232 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 KIF1AQ12756 1690 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 NBR1Q14596 966 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 ALS2Q96Q42 1657 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 IL17REQ8NFR9 667 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 LRRC37A3O60309 1634 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 SMC5Q8IY18 1101 aa23.47■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.47■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.46■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 RGS12O14924 1447 aa23.46■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 RGPD5Q99666 1765 aa23.45■■□□□ 1.35
SYTL1-208ENST00000543823 DCCP43146 1447 aa23.45■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 KIAA0232Q92628 1395 aa23.45■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 MAP3K5Q99683 1374 aa23.45■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.44■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.44■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 LNPKQ9C0E8 428 aa23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.41■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 PXDNQ92626 1479 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 G2E3Q7L622 706 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 LGR6Q9HBX8 967 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 SLC4A2P04920 1241 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 NUCB1Q02818 461 aa23.39■■□□□ 1.34
SYTL1-208ENST00000543823 NECTIN2Q92692 538 aa23.39■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 NCAPD2Q15021 1401 aa23.38■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.36■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 BRINP3Q76B58 766 aa23.36■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.36■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 F6X3S4 739 aa23.35■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.35■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 ERBB3P21860 1342 aa23.35■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.35■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.34■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.34■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 CHRNA2Q15822 529 aa23.33■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SYTL1-208ENST00000543823 KCNQ3O43525 872 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 COL18A1P39060 1754 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 MEIS3Q99687 375 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 PTPRCP08575 1304 aa23.31■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.31■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.31■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.31■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.31■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 ATP10DQ9P241 1426 aa23.3■■□□□ 1.32
SYTL1-208ENST00000543823 GCC1Q96CN9 775 aa23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms