RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.02■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 NCAPD2Q15021 1401 aa26.02■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 NSD2O96028 1365 aa26.01■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 NBPF6Q5VWK0 638 aa26■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 NBPF4Q96M43 638 aa26■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 CARD14Q9BXL6 1004 aa26■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 LRRC4BQ9NT99 713 aa26■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 MAP3K5Q99683 1374 aa25.98■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.98■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.98■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB7AO95365 584 aa25.97■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 AKT1S1Q96B36 256 aa25.97■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.96■■□□□ 1.75
LTBR-211ENST00000543190 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.95■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.94■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.94■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 UTRNP46939 3433 aa25.94■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 ZNF827Q17R98 1081 aa25.93■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.93■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.92■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 ITGB4P16144 1822 aa25.91■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.91■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.9■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.9■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 CHD4Q14839 1912 aa25.9■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 SYT17Q9BSW7 474 aa25.9■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.89■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
LTBR-211ENST00000543190 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.87■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.86■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.86■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 C5P01031 1676 aa25.86■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 YY1P25490 414 aa25.84■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.84■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 ARXQ96QS3 562 aa25.84■■□□□ 1.73
LTBR-211ENST00000543190 CYP27B1O15528 508 aa25.82■■□□□ 1.72
LTBR-211ENST00000543190 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
LTBR-211ENST00000543190 POLKQ9UBT6 870 aa25.8■■□□□ 1.72
LTBR-211ENST00000543190 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
LTBR-211ENST00000543190 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.79■■□□□ 1.72
LTBR-211ENST00000543190 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.78■■□□□ 1.72
LTBR-211ENST00000543190 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
LTBR-211ENST00000543190 EYA1Q99502 592 aa25.76■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.75■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 PALLDQ8WX93 1383 aa25.75■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 SPG7Q9UQ90 795 aa25.75■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 POLD1P28340 1107 aa25.74■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 KCNQ4P56696 695 aa25.74■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 C4BP0C0L5 1744 aa25.74■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.74■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.73■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
LTBR-211ENST00000543190 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.69■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.69■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 PIGBQ92521 554 aa25.68■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.67■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 PANK3Q9H999 370 aa25.67■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 PHKG2P15735 406 aa25.66■■□□□ 1.7
LTBR-211ENST00000543190 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.6■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.6■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 SIK1P57059 783 aa25.6■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.6■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 KDRP35968 1356 aa25.59■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 SSFA2P28290 1259 aa25.59■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.59■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
LTBR-211ENST00000543190 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.57■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 DCAF5Q96JK2 942 aa25.57■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 AK7Q96M32 723 aa25.56■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.56■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 GPR162Q16538 588 aa25.55■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.55■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.55■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.54■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 ATG3Q9NT62 314 aa25.54■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.54■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
LTBR-211ENST00000543190 MORC1Q86VD1 984 aa25.53■■□□□ 1.68
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