RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543175.4

PTRH1-208, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTRH1-208	ENST00000543175	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85
PTRH1-208	ENST00000543175	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTRH1-208	ENST00000543175	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	LY75	O60449	1722 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PTRH1-208	ENST00000543175	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	NSD2	O96028	1365 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PTRH1-208	ENST00000543175	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	ITGB4	P16144	1822 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	PTGER2	P43116	358 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PTRH1-208	ENST00000543175	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PTRH1-208	ENST00000543175	PANK3	Q9H999	370 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PTRH1-208	ENST00000543175	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PTRH1-208	ENST00000543175	CYP27B1	O15528	508 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PTRH1-208	ENST00000543175	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
PTRH1-208	ENST00000543175	C5	P01031	1676 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PTRH1-208	ENST00000543175	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.57	■■■□□ 2.81
PTRH1-208	ENST00000543175	KCNQ4	P56696	695 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	EYA1	Q99502	592 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PTRH1-208	ENST00000543175	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.5	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	ARX	Q96QS3	562 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PTRH1-208	ENST00000543175	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	PHKG2	P15735	406 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	PIGB	Q92521	554 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PTRH1-208	ENST00000543175	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PTRH1-208	ENST00000543175	POLD1	P28340	1107 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTRH1-208	ENST00000543175	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PTRH1-208	ENST00000543175	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PTRH1-208	ENST00000543175	YY1	P25490	414 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTRH1-208	ENST00000543175	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
PTRH1-208	ENST00000543175	MSH5	O43196	834 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	CHD4	Q14839	1912 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	SIK1	P57059	783 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTRH1-208	ENST00000543175	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	AK7	Q96M32	723 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	KDR	P35968	1356 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	IL13	P35225	146 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.23	■■■□□ 2.75

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