RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

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Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 ITSN1Q15811 1721 aa22.38■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 MSH6P52701 1360 aa22.38■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.38■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.38■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 SIRT1Q96EB6 747 aa22.38■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.37■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 GCC1Q96CN9 775 aa22.37■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 TECPR2O15040 1411 aa22.36■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.35■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 TBX22Q9Y458 520 aa22.34■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.34■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.34■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 STK31Q9BXU1 1019 aa22.33■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
GRAMD2B-218ENST00000542322 PTCH1Q13635 1447 aa22.33■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANXA1P04083 346 aa22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 PSME1Q06323 249 aa22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 C3P01024 1663 aa22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 FLT4P35916 1363 aa22.31■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 HOXC9P31274 260 aa22.31■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.31■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.31■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 CEP85Q6P2H3 762 aa22.3■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 PIK3R4Q99570 1358 aa22.3■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.29■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 PEAK1Q9H792 1746 aa22.29■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.28■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.28■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.27■■□□□ 1.16
GRAMD2B-218ENST00000542322 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.27■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 IL17REQ8NFR9 667 aa22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 AKAP12Q02952 1782 aa22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 SBNO1A3KN83 1393 aa22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 DCTPP1Q9H773 170 aa22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 ORAI2Q96SN7 254 aa22.25■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 CDC45O75419 566 aa22.25■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 LGR6Q9HBX8 967 aa22.25■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 FLIIQ13045 1269 aa22.24■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.24■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 RTL1A6NKG5 1358 aa22.23■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 KCNQ3O43525 872 aa22.23■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 CRB1P82279 1406 aa22.23■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.22■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.22■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 NBPF4Q96M43 638 aa22.22■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.22■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.22■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 DIP2AQ14689 1571 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 SDSP20132 328 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP31Q70CQ4 1352 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 TTC22Q5TAA0 569 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 RILPL2Q969X0 211 aa22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.2■■□□□ 1.15
GRAMD2B-218ENST00000542322 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.2■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 MCM4P33991 863 aa22.2■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARHGEF10O15013 1369 aa22.19■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 RGS12O14924 1447 aa22.19■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 PTPRCP08575 1304 aa22.19■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.18■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 KIF2CQ99661 725 aa22.18■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 GNAI2P04899 355 aa22.17■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 HMMRO75330 724 aa22.17■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 SSH2Q76I76 1423 aa22.16■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 ATP10DQ9P241 1426 aa22.16■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 TEFQ10587 303 aa22.15■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 KIAA0232Q92628 1395 aa22.15■■□□□ 1.14
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRAK2O60296 914 aa22.14■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.14■■□□□ 1.13
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