RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H7C1W4 665 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHOQP17081 205 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MX2P20592 715 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL8A1P27658 744 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPC1P35052 558 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAP2K3P46734 347 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTK2Q05397 1052 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAM32Q8TC27 787 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ESPNB1AK53 854 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ITGB7P26010 798 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM66O15016 1216 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB15P59190 212 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LCE3BQ5TA77 95 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM52Q96A61 297 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POU4F2Q12837 409 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NR6A1Q15406 480 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR44Q5JSH3 913 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLRG1Q96E93 195 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRIN2CQ14957 1233 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD163Q86VB7 1156 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBPF15Q8N660 670 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RRAGCQ9HB90 399 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYLDQ9NQC7 956 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PRU2 124 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEN1O00255 615 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIK3R2O00459 728 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 F11P03951 625 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THBS1P07996 1170 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNB5O14775 395 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AK7Q96M32 723 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHF24Q9UPV7 400 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHRNA4P43681 627 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNMA1Q8ND90 353 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLRP3Q96P20 1036 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLN3Q13286 438 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC125Q86Z20 511 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AMPD1P23109 780 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DGKGP49619 791 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERVK-9P63128 1117 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DOC2BQ14184 412 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDE4DQ08499 809 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.58□□□□□ -1.36
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