RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514485.5

PACRGL-231, Transcript of parkin coregulated like, human

TSL 3

Gene PACRGL, Length 860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACRGL-231	ENST00000514485	LY75	O60449	1722 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PACRGL-231	ENST00000514485	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	NBPF4	Q96M43	638 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	STK32B	Q9NY57	414 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	SLC15A2	Q16348	729 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	INSR	P06213	1382 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	FLT4	P35916	1363 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PACRGL-231	ENST00000514485	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	NSD2	O96028	1365 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	ITGB4	P16144	1822 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	PTGER2	P43116	358 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PACRGL-231	ENST00000514485	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	MORC1	Q86VD1	984 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	POLK	Q9UBT6	870 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	UTRN	P46939	3433 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	KCNQ4	P56696	695 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	C5	P01031	1676 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PACRGL-231	ENST00000514485	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PACRGL-231	ENST00000514485	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29	■■■□□ 2.23
PACRGL-231	ENST00000514485	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PACRGL-231	ENST00000514485	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PACRGL-231	ENST00000514485	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PACRGL-231	ENST00000514485	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PACRGL-231	ENST00000514485	CYP27B1	O15528	508 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PACRGL-231	ENST00000514485	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PACRGL-231	ENST00000514485	EYA1	Q99502	592 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PACRGL-231	ENST00000514485	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PACRGL-231	ENST00000514485	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PACRGL-231	ENST00000514485	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PACRGL-231	ENST00000514485	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PACRGL-231	ENST00000514485	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PACRGL-231	ENST00000514485	CHD4	Q14839	1912 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	ARX	Q96QS3	562 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	YY1	P25490	414 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PACRGL-231	ENST00000514485	MTHFS	P49914	203 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PACRGL-231	ENST00000514485	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PACRGL-231	ENST00000514485	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PACRGL-231	ENST00000514485	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.8	■■■□□ 2.2	9e-6	■□□□□ 9.4
PACRGL-231	ENST00000514485	PIGB	Q92521	554 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PACRGL-231	ENST00000514485	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PACRGL-231	ENST00000514485	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PACRGL-231	ENST00000514485	PHKG2	P15735	406 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	POLD1	P28340	1107 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	MSH5	O43196	834 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	IL13	P35225	146 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PACRGL-231	ENST00000514485	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PACRGL-231	ENST00000514485	SIK1	P57059	783 aa		28.67	■■■□□ 2.18

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