RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513056.5

FAM53C-211, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53C, Length 923 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-211ENST00000513056 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 NSD2O96028 1365 aa25.73■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 POLD1P28340 1107 aa25.72■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 MEGF6O75095 1541 aa25.72■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 AMPHP49418 695 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.7■■□□□ 1.71
FAM53C-211ENST00000513056 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM53C-211ENST00000513056 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM53C-211ENST00000513056 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM53C-211ENST00000513056 GPR162Q16538 588 aa25.66■■□□□ 1.7
FAM53C-211ENST00000513056 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
FAM53C-211ENST00000513056 FBLN1P23142 703 aa25.64■■□□□ 1.7
FAM53C-211ENST00000513056 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
FAM53C-211ENST00000513056 KCNQ4P56696 695 aa25.63■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 USP47Q96K76 1375 aa25.63■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 FYB1O15117 783 aa25.62■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.62■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 NBPF4Q96M43 638 aa25.62■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.62■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 C5P01031 1676 aa25.61■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.61■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 C1QTNF8P60827 252 aa25.6■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 KLHL34Q8N239 644 aa25.6■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.6■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 INSRP06213 1382 aa25.59■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.59■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 TMF1P82094 1093 aa25.58■■□□□ 1.69
FAM53C-211ENST00000513056 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.57■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.57■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.57■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.57■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 FLT4P35916 1363 aa25.56■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.55■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.54■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 ITGB4P16144 1822 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 GRIN3BO60391 1043 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 CDCA8Q53HL2 280 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.51■■□□□ 1.68
FAM53C-211ENST00000513056 MSH5O43196 834 aa25.51■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 PALLDQ8WX93 1383 aa25.51■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 NCAPD2Q15021 1401 aa25.5■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.5■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 C4BP0C0L5 1744 aa25.49■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.677e-7■□□□□ 9.1
FAM53C-211ENST00000513056 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 CYP27B1O15528 508 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM53C-211ENST00000513056 MSL1Q68DK7 614 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.41■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 AK7Q96M32 723 aa25.4■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.4■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
FAM53C-211ENST00000513056 PIGBQ92521 554 aa25.38■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 SPG7Q9UQ90 795 aa25.38■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.37■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 ATP10DQ9P241 1426 aa25.37■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.36■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 SSFA2P28290 1259 aa25.36■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 ADCY9O60503 1353 aa25.35■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.34■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 SIK1P57059 783 aa25.34■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.34■■□□□ 1.65
FAM53C-211ENST00000513056 EYA1Q99502 592 aa25.32■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 CEP350Q5VT06 3117 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 PHF14O94880 888 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 PHKG2P15735 406 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 POLKQ9UBT6 870 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM53C-211ENST00000513056 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 ITPK1Q13572 414 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 KDRP35968 1356 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 GNPATO15228 680 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 ATP6V1AP38606 617 aa25.24■■□□□ 1.63
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