RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.21■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.2■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.2■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.19■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB7AO95365 584 aa34.18■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.18■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.16■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.15■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.06
ALYREF-203ENST00000511412 NSD2O96028 1365 aa34.13■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC4BQ9NT99 713 aa34.13■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 LY75O60449 1722 aa34.13■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 SLC27A3Q5K4L6 730 aa34.12■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF827Q17R98 1081 aa34.1■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 MTFR1LQ9H019 292 aa34.1■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.1■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 PTGER2P43116 358 aa34.09■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.08■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.08■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.07■■■■□ 3.05
ALYREF-203ENST00000511412 NCAPD2Q15021 1401 aa34.05■■■■□ 3.04
ALYREF-203ENST00000511412 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.03■■■■□ 3.04
ALYREF-203ENST00000511412 AKT1S1Q96B36 256 aa34.03■■■■□ 3.04
ALYREF-203ENST00000511412 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.03■■■■□ 3.04
ALYREF-203ENST00000511412 DCAF8L1A6NGE4 600 aa34.01■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.99■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 SGIP1Q9BQI5 828 aa33.99■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 KCNQ4P56696 695 aa33.98■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 POLKQ9UBT6 870 aa33.98■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 CYP27B1O15528 508 aa33.95■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 PANK3Q9H999 370 aa33.95■■■■□ 3.03
ALYREF-203ENST00000511412 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa33.94■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 ITGB4P16144 1822 aa33.94■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa33.94■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 C5P01031 1676 aa33.93■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 EYA1Q99502 592 aa33.93■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 SLC16A10Q8TF71 515 aa33.92■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 COL24A1Q17RW2 1714 aa33.91■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 ARXQ96QS3 562 aa33.91■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 SPG7Q9UQ90 795 aa33.91■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 PALLDQ8WX93 1383 aa33.89■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 SYT17Q9BSW7 474 aa33.89■■■■□ 3.02
ALYREF-203ENST00000511412 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.88■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 YY1P25490 414 aa33.87■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 TAF1LQ8IZX4 1826 aa33.86■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K5Q99683 1374 aa33.85■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.84■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 POLD1P28340 1107 aa33.83■■■■□ 3.01
ALYREF-203ENST00000511412 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 IGSF1Q8N6C5 1336 aa33.8■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 C4BP0C0L5 1744 aa33.79■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 MORC1Q86VD1 984 aa33.78■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.78■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 PIGBQ92521 554 aa33.78■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 MSH5O43196 834 aa33.77■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 PHKG2P15735 406 aa33.77■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 KNSTRNQ9Y448 316 aa33.77■■■■□ 3
ALYREF-203ENST00000511412 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
ALYREF-203ENST00000511412 KLHL34Q8N239 644 aa33.74■■■□□ 2.99
ALYREF-203ENST00000511412 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.74■■■□□ 2.99
ALYREF-203ENST00000511412 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.73■■■□□ 2.99
ALYREF-203ENST00000511412 FLAD1Q8NFF5 587 aa33.7■■■□□ 2.99
ALYREF-203ENST00000511412 AK7Q96M32 723 aa33.69■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 UBR3Q6ZT12 1888 aa33.69■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.66■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 UTRNP46939 3433 aa33.66■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 SIK1P57059 783 aa33.66■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 MSL1Q68DK7 614 aa33.65■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.64■■■□□ 2.98
ALYREF-203ENST00000511412 CHD4Q14839 1912 aa33.63■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.62■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 AEBP1Q8IUX7 1158 aa33.61■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 DCAF5Q96JK2 942 aa33.61■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 GPR162Q16538 588 aa33.6■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 LINC00116Q8NCU8 138 aa33.6■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.59■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 PHF14O94880 888 aa33.59■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 NLGN2Q8NFZ4 835 aa33.59■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 ATG3Q9NT62 314 aa33.59■■■□□ 2.97
ALYREF-203ENST00000511412 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
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