RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 NHSQ6T4R5 1651 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 BTAF1O14981 1849 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 NCAPD2Q15021 1401 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 BCL9O00512 1426 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 SPG7Q9UQ90 795 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX1-204ENST00000504936 RREB1Q92766 1687 aa25.64■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 CFAP53Q96M91 514 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 KCNQ2O43526 872 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 IL13P35225 146 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 ITGB4P16144 1822 aa25.6■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 PPP2R1AP30153 589 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-204ENST00000504936 HMOX1P09601 288 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 CYP27B1O15528 508 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 NUDCQ9Y266 331 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 KDRP35968 1356 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-204ENST00000504936 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.51■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 PLSCR1O15162 318 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 PHKG2P15735 406 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 RALBP1Q15311 655 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 NBPF14Q5TI25 921 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 LY75O60449 1722 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-204ENST00000504936 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 TXNRD1Q16881 649 aa25.45■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 PRKAR2BP31323 418 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 DCAF5Q96JK2 942 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX1-204ENST00000504936 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 PROM2Q8N271 834 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 PALLDQ8WX93 1383 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 STK32BQ9NY57 414 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 C5P01031 1676 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 CABP4P57796 275 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 PIGBQ92521 554 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 NEFMP07197 916 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 PAPPAQ13219 1627 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 KCNQ4P56696 695 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-204ENST00000504936 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.33■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 MAP3K5Q99683 1374 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 FCHSD2O94868 740 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 SLC15A2Q16348 729 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 LGR6Q9HBX8 967 aa25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms