RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-215ENST00000502470 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
MIB2-215ENST00000502470 DOT1LQ8TEK3 1739 aa37.36■■■■□ 3.57
MIB2-215ENST00000502470 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
MIB2-215ENST00000502470 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
MIB2-215ENST00000502470 TXNRD1Q16881 649 aa37.31■■■■□ 3.56
MIB2-215ENST00000502470 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
MIB2-215ENST00000502470 POLKQ9UBT6 870 aa37.31■■■■□ 3.56
MIB2-215ENST00000502470 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
MIB2-215ENST00000502470 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa37.29■■■■□ 3.56
MIB2-215ENST00000502470 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.29■■■■□ 3.56
MIB2-215ENST00000502470 KIF7Q2M1P5 1343 aa37.26■■■■□ 3.56
MIB2-215ENST00000502470 TATP17735 454 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
MIB2-215ENST00000502470 NSD2O96028 1365 aa37.24■■■■□ 3.55
MIB2-215ENST00000502470 NCAPD2Q15021 1401 aa37.24■■■■□ 3.55
MIB2-215ENST00000502470 CASZ1Q86V15 1759 aa37.24■■■■□ 3.55
MIB2-215ENST00000502470 PKD1L3Q7Z443 1732 aa37.23■■■■□ 3.55
MIB2-215ENST00000502470 PAPPAQ13219 1627 aa37.2■■■■□ 3.55
MIB2-215ENST00000502470 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 EYA1Q99502 592 aa37.18■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 KNSTRNQ9Y448 316 aa37.17■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 LY75O60449 1722 aa37.16■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa37.14■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa37.14■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 MORC1Q86VD1 984 aa37.14■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 STK32BQ9NY57 414 aa37.14■■■■□ 3.54
MIB2-215ENST00000502470 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
MIB2-215ENST00000502470 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa37.13■■■■□ 3.53
MIB2-215ENST00000502470 SLC15A2Q16348 729 aa37.12■■■■□ 3.53
MIB2-215ENST00000502470 ITGB4P16144 1822 aa37.12■■■■□ 3.53
MIB2-215ENST00000502470 LRRC4BQ9NT99 713 aa37.11■■■■□ 3.53
MIB2-215ENST00000502470 CYP27B1O15528 508 aa37.1■■■■□ 3.53
MIB2-215ENST00000502470 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
MIB2-215ENST00000502470 SPON1Q9HCB6 807 aa37.07■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 SLC27A3Q5K4L6 730 aa37.03■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa37.03■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 ZNF827Q17R98 1081 aa37.02■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 SPG7Q9UQ90 795 aa37.02■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 IGSF1Q8N6C5 1336 aa37.02■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 KCNQ4P56696 695 aa37.01■■■■□ 3.52
MIB2-215ENST00000502470 QSER1Q2KHR3 1735 aa37.01■■■■□ 3.51
MIB2-215ENST00000502470 ZBTB7AO95365 584 aa36.99■■■■□ 3.51
MIB2-215ENST00000502470 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.98■■■■□ 3.51
MIB2-215ENST00000502470 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
MIB2-215ENST00000502470 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.96■■■■□ 3.51
MIB2-215ENST00000502470 AKT1S1Q96B36 256 aa36.95■■■■□ 3.51
MIB2-215ENST00000502470 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 TAF1LQ8IZX4 1826 aa36.94■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 C5P01031 1676 aa36.93■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 PHKG2P15735 406 aa36.91■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.91■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.9■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 PTGER2P43116 358 aa36.89■■■■□ 3.5
MIB2-215ENST00000502470 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.88■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 PALLDQ8WX93 1383 aa36.88■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 MTFR1LQ9H019 292 aa36.87■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 IL13P35225 146 aa36.86■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 MTHFSP49914 203 aa36.86■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 PIGBQ92521 554 aa36.86■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa36.84■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.82■■■■□ 3.49
MIB2-215ENST00000502470 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.82■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa36.82■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 SGIP1Q9BQI5 828 aa36.81■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 KDRP35968 1356 aa36.8■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 COL24A1Q17RW2 1714 aa36.8■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.79■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 C4BP0C0L5 1744 aa36.76■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.76■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
MIB2-215ENST00000502470 SLC16A10Q8TF71 515 aa36.73■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.73■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 DCAF5Q96JK2 942 aa36.71■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.71■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 SCN11AQ9UI33 1791 aa36.71■■■■□ 3.47
MIB2-215ENST00000502470 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.69■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.68■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 HMOX1P09601 288 aa36.68■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 SIK1P57059 783 aa36.68■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 ATG3Q9NT62 314 aa36.68■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 ARXQ96QS3 562 aa36.67■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.66■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
MIB2-215ENST00000502470 MSH5O43196 834 aa36.63■■■■□ 3.45
MIB2-215ENST00000502470 SYT17Q9BSW7 474 aa36.63■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms