RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492582.5

CHKB-212, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 2,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-212ENST00000492582 KRT24Q2M2I5 525 aa36.47■■■■□ 3.43
CHKB-212ENST00000492582 SEC24BO95487 1268 aa36.46■■■■□ 3.43
CHKB-212ENST00000492582 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.46■■■■□ 3.43
CHKB-212ENST00000492582 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
CHKB-212ENST00000492582 RTL1A6NKG5 1358 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 C14orf37Q86TY3 774 aa36.43■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 NBR1Q14596 966 aa36.41■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 LRRC37A3O60309 1634 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 LTN1O94822 1766 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 NUCB1Q02818 461 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 NFAT5O94916 1531 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-212ENST00000492582 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 RGS12O14924 1447 aa36.37■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 C1orf115Q9H7X2 142 aa36.37■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 PSME1Q06323 249 aa36.35■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 MIS18AQ9NYP9 233 aa36.35■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 TSPYL4Q9UJ04 414 aa36.35■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 SLC4A3P48751 1232 aa36.33■■■■□ 3.41
CHKB-212ENST00000492582 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 IP6K1Q92551 441 aa36.31■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 GCC1Q96CN9 775 aa36.31■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 PTPRCP08575 1304 aa36.31■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 CHD1LQ86WJ1 897 aa36.31■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 GNAT3A8MTJ3 354 aa36.3■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 SIRT2Q8IXJ6 389 aa36.3■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 LNPKQ9C0E8 428 aa36.28■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 MAP3K5Q99683 1374 aa36.28■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 MSH6P52701 1360 aa36.27■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.27■■■■□ 3.4
CHKB-212ENST00000492582 ORAI2Q96SN7 254 aa36.25■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 TBC1D32Q96NH3 1257 aa36.24■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 SLC4A2P04920 1241 aa36.23■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.23■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 ANKRD45Q5TZF3 282 aa36.21■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 IL17REQ8NFR9 667 aa36.21■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.21■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 HSPA2P54652 639 aa36.2■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 BCL11AQ9H165 835 aa36.2■■■■□ 3.39
CHKB-212ENST00000492582 SLIT3O75094 1523 aa36.19■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 ATP10DQ9P241 1426 aa36.17■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.17■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 NBPF4Q96M43 638 aa36.17■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 BABAM1Q9NWV8 329 aa36.17■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 G2E3Q7L622 706 aa36.15■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 KIF1AQ12756 1690 aa36.14■■■■□ 3.38
CHKB-212ENST00000492582 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.12■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 GCP02774 474 aa36.12■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 ANKRD44Q8N8A2 993 aa36.12■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.12■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.11■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 BMP2KLQ5H9B9 411 aa36.11■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.11■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 STK31Q9BXU1 1019 aa36.11■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 DCTPP1Q9H773 170 aa36.1■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa36.09■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 BECN1Q14457 450 aa36.09■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 MEIS3Q99687 375 aa36.09■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 CCDC30Q5VVM6 783 aa36.09■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 CEP85Q6P2H3 762 aa36.08■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.08■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 USP35Q9P2H5 1018 aa36.08■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CHKB-212ENST00000492582 CCT4P50991 539 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.06■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 NCAPD2Q15021 1401 aa36.06■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 F6X3S4 739 aa36.05■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 C22orf23Q9BZE7 217 aa36.05■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 STRCQ7RTU9 1775 aa36.05■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.03■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.03■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 MST1RQ04912 1400 aa36.03■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 FLIIQ13045 1269 aa36.02■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 SLC4A10Q6U841 1118 aa36.02■■■■□ 3.36
CHKB-212ENST00000492582 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 CACNA1FO60840 1977 aa35.99■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 ALS2Q96Q42 1657 aa35.98■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 PLEKHG5O94827 1062 aa35.98■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 NECTIN2Q92692 538 aa35.98■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 LGR6Q9HBX8 967 aa35.98■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.97■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.97■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 KDM3BQ7LBC6 1761 aa35.97■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
CHKB-212ENST00000492582 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
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