RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 SHANK3Q9BYB0 1731 aa40.23■■■■■ 4.03
MTMR1-211ENST00000490316 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa40.22■■■■■ 4.03
MTMR1-211ENST00000490316 SPON1Q9HCB6 807 aa40.21■■■■■ 4.03
MTMR1-211ENST00000490316 STK32BQ9NY57 414 aa40.21■■■■■ 4.03
MTMR1-211ENST00000490316 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa40.19■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 TATP17735 454 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 SLC15A2Q16348 729 aa40.17■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 PANK3Q9H999 370 aa40.17■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 CASZ1Q86V15 1759 aa40.17■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 DOT1LQ8TEK3 1739 aa40.15■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.15■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
MTMR1-211ENST00000490316 POLKQ9UBT6 870 aa40.13■■■■■ 4.01
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MTMR1-211ENST00000490316 PAPPAQ13219 1627 aa40.09■■■■■ 4.01
MTMR1-211ENST00000490316 LRRC4BQ9NT99 713 aa40.08■■■■■ 4.01
MTMR1-211ENST00000490316 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
MTMR1-211ENST00000490316 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
MTMR1-211ENST00000490316 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa40.07■■■■■ 4
MTMR1-211ENST00000490316 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa40.07■■■■■ 4
MTMR1-211ENST00000490316 NSD2O96028 1365 aa40.06■■■■■ 4
MTMR1-211ENST00000490316 NCAPD2Q15021 1401 aa40.06■■■■■ 4
MTMR1-211ENST00000490316 SLC27A3Q5K4L6 730 aa40.05■■■■■ 4
MTMR1-211ENST00000490316 ZBTB7AO95365 584 aa40.03■■■■■ 4
MTMR1-211ENST00000490316 EYA1Q99502 592 aa40.02■■■■■ 4
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MTMR1-211ENST00000490316 CYP27B1O15528 508 aa39.98■■■■□ 3.99
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF827Q17R98 1081 aa39.98■■■■□ 3.99
MTMR1-211ENST00000490316 LY75O60449 1722 aa39.98■■■■□ 3.99
MTMR1-211ENST00000490316 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
MTMR1-211ENST00000490316 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
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MTMR1-211ENST00000490316 KNSTRNQ9Y448 316 aa39.95■■■■□ 3.99
MTMR1-211ENST00000490316 MTFR1LQ9H019 292 aa39.94■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 SPG7Q9UQ90 795 aa39.94■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 PTGER2P43116 358 aa39.93■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 MORC1Q86VD1 984 aa39.93■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 KIF7Q2M1P5 1343 aa39.92■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 KCNQ4P56696 695 aa39.92■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
MTMR1-211ENST00000490316 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 QSER1Q2KHR3 1735 aa39.86■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa39.86■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa39.86■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 SGIP1Q9BQI5 828 aa39.83■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa39.83■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 ITGB4P16144 1822 aa39.83■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 IGSF1Q8N6C5 1336 aa39.83■■■■□ 3.97
MTMR1-211ENST00000490316 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa39.8■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa39.8■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 IFNL2Q8IZJ0 200 aa39.79■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 SLC16A10Q8TF71 515 aa39.79■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 PALLDQ8WX93 1383 aa39.79■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa39.77■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 PHKG2P15735 406 aa39.77■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 PIGBQ92521 554 aa39.76■■■■□ 3.96
MTMR1-211ENST00000490316 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
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MTMR1-211ENST00000490316 DCAF8L1A6NGE4 600 aa39.72■■■■□ 3.95
MTMR1-211ENST00000490316 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
MTMR1-211ENST00000490316 ARXQ96QS3 562 aa39.72■■■■□ 3.95
MTMR1-211ENST00000490316 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
MTMR1-211ENST00000490316 SYT17Q9BSW7 474 aa39.69■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 TMOD3Q9NYL9 352 aa39.69■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 TAF1LQ8IZX4 1826 aa39.68■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 COL24A1Q17RW2 1714 aa39.65■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 IL13P35225 146 aa39.64■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 AMOTQ4VCS5 1084 aa39.64■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 AEBP1Q8IUX7 1158 aa39.64■■■■□ 3.94
MTMR1-211ENST00000490316 POLD1P28340 1107 aa39.63■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 MSH5O43196 834 aa39.62■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 MTHFSP49914 203 aa39.61■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 SULT6B1Q6IMI4 303 aa39.61■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 DCAF5Q96JK2 942 aa39.6■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 ASAP1Q9ULH1 1129 aa39.6■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 C4BP0C0L5 1744 aa39.59■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 KDRP35968 1356 aa39.59■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 MAP3K5Q99683 1374 aa39.59■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa39.58■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 SIK1P57059 783 aa39.58■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 ERVV-2B6SEH9 535 aa39.57■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 FLAD1Q8NFF5 587 aa39.57■■■■□ 3.93
MTMR1-211ENST00000490316 ATG3Q9NT62 314 aa39.55■■■■□ 3.92
MTMR1-211ENST00000490316 AK7Q96M32 723 aa39.54■■■■□ 3.92
MTMR1-211ENST00000490316 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa39.53■■■■□ 3.92
MTMR1-211ENST00000490316 C1orf141Q5JVX7 400 aa39.52■■■■□ 3.92
MTMR1-211ENST00000490316 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
MTMR1-211ENST00000490316 YY1P25490 414 aa39.5■■■■□ 3.91
MTMR1-211ENST00000490316 ATP6V1AP38606 617 aa39.5■■■■□ 3.91
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