RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 CCDC69A6NI79 296 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 STK38Q15208 465 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 TRAK2O60296 914 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 CDKL5O76039 1030 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 ZNF592Q92610 1267 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 ARID3AQ99856 593 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 HYPKQ9NX55 129 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 A2MP01023 1474 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 EPS15P42566 896 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 NUP160Q12769 1436 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 PTPRCP08575 1304 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 DCTN1Q14203 1278 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 ATP2B1P20020 1258 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 RAI14Q9P0K7 980 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 TDO2P48775 406 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 METTL24Q5JXM2 366 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 ZPR1O75312 459 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 ACEP12821 1306 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 OFD1O75665 1012 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 IL16Q14005 1332 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 SOGA3Q5TF21 947 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 EXOC5O00471 708 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 MX1P20591 662 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 KRT85P78386 507 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 MYD88Q99836 296 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 FIBPO43427 364 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 ATP2B2Q01814 1243 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 TSPY26PQ9H489 355 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 KDM4AO75164 1064 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 WASF1Q92558 559 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 AIDAQ96BJ3 306 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 STK3Q13188 491 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 TRIM5Q9C035 493 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-213ENST00000489895 DACH1Q9UI36 760 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms