RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 MTHFSP49914 203 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 KCNQ2O43526 872 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 IL13P35225 146 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-216ENST00000475195 NHSQ6T4R5 1651 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 CYP27B1O15528 508 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 PROM2Q8N271 834 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 SPG7Q9UQ90 795 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 KDRP35968 1356 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 RREB1Q92766 1687 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-216ENST00000475195 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 PPP2R1AP30153 589 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 BTAF1O14981 1849 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 PHKG2P15735 406 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 TXNRD1Q16881 649 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF14Q5TI25 921 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-216ENST00000475195 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 CFAP53Q96M91 514 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 HMOX1P09601 288 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 RALBP1Q15311 655 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 DCAF5Q96JK2 942 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 ITGB4P16144 1822 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-216ENST00000475195 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 PIGBQ92521 554 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 LY75O60449 1722 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 NUDCQ9Y266 331 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 SLC15A2Q16348 729 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 PAPPAQ13219 1627 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-216ENST00000475195 FCHSD2O94868 740 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 AKT1S1Q96B36 256 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 STK32BQ9NY57 414 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 PALLDQ8WX93 1383 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 KCNQ4P56696 695 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 ATG3Q9NT62 314 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 CABP4P57796 275 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 LGR6Q9HBX8 967 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 PRKAR2BP31323 418 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF827Q17R98 1081 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-216ENST00000475195 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-216ENST00000475195 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-216ENST00000475195 LRP5O75197 1615 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-216ENST00000475195 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ATG4B-216ENST00000475195 CASZ1Q86V15 1759 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-216ENST00000475195 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms