RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-208ENST00000468310 FLT4P35916 1363 aa29.81■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.81■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 INSRP06213 1382 aa29.8■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.79■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 ZBTB7AO95365 584 aa29.79■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.79■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 PAPPAQ13219 1627 aa29.77■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.76■■■□□ 2.36
PRKCZ-208ENST00000468310 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.76■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.72■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.71■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.7■■■□□ 2.35
PRKCZ-208ENST00000468310 ZNF827Q17R98 1081 aa29.68■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 MTFR1LQ9H019 292 aa29.68■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 NSD2O96028 1365 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 PTGER2P43116 358 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 LY75O60449 1722 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.66■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 KCNQ4P56696 695 aa29.64■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.64■■■□□ 2.34
PRKCZ-208ENST00000468310 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 AKT1S1Q96B36 256 aa29.63■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.62■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.62■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 PANK3Q9H999 370 aa29.61■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 POLKQ9UBT6 870 aa29.61■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.59■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 NCAPD2Q15021 1401 aa29.58■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.58■■■□□ 2.33
PRKCZ-208ENST00000468310 CYP27B1O15528 508 aa29.57■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 EYA1Q99502 592 aa29.57■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.56■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 SPG7Q9UQ90 795 aa29.56■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.55■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.55■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 ITGB4P16144 1822 aa29.55■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.54■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 ARXQ96QS3 562 aa29.54■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.52■■■□□ 2.32
PRKCZ-208ENST00000468310 C5P01031 1676 aa29.51■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 SYT17Q9BSW7 474 aa29.51■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 YY1P25490 414 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 PALLDQ8WX93 1383 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 MSH5O43196 834 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 MORC1Q86VD1 984 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 POLD1P28340 1107 aa29.47■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.46■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.45■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
PRKCZ-208ENST00000468310 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.45■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.43■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 KLHL34Q8N239 644 aa29.43■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 PIGBQ92521 554 aa29.43■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.42■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 PHKG2P15735 406 aa29.41■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.41■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 MAP3K5Q99683 1374 aa29.4■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 C4BP0C0L5 1744 aa29.39■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.39■■■□□ 2.3
PRKCZ-208ENST00000468310 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.38■■■□□ 2.29
PRKCZ-208ENST00000468310 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.35■■■□□ 2.29
PRKCZ-208ENST00000468310 AK7Q96M32 723 aa29.35■■■□□ 2.29
PRKCZ-208ENST00000468310 MSL1Q68DK7 614 aa29.34■■■□□ 2.29
PRKCZ-208ENST00000468310 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
PRKCZ-208ENST00000468310 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.33■■■□□ 2.29
PRKCZ-208ENST00000468310 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 SIK1P57059 783 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.29■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 PHF14O94880 888 aa29.29■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 GPR162Q16538 588 aa29.29■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.29■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.29■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 DCAF5Q96JK2 942 aa29.28■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 ATG3Q9NT62 314 aa29.28■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 ATP6V1AP38606 617 aa29.27■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.27■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.27■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 CHD4Q14839 1912 aa29.27■■■□□ 2.28
PRKCZ-208ENST00000468310 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.26■■■□□ 2.27
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