RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466244.1

RAB17-209, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB17, Length 937 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17-209ENST00000466244 NHSQ6T4R5 1651 aa20.42■□□□□ 0.86
RAB17-209ENST00000466244 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RAB17-209ENST00000466244 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RAB17-209ENST00000466244 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.41■□□□□ 0.86
RAB17-209ENST00000466244 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RAB17-209ENST00000466244 PPP2R1AP30153 589 aa20.4■□□□□ 0.86
RAB17-209ENST00000466244 TRIM37O94972 964 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 CYP27B1O15528 508 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 BAG6P46379 1132 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 RREB1Q92766 1687 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 RALBP1Q15311 655 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 PLSCR1O15162 318 aa20.33■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RAB17-209ENST00000466244 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 SPG7Q9UQ90 795 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 KCNQ2O43526 872 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 APBA3O96018 575 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 BTAF1O14981 1849 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 PHKG2P15735 406 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 CFAP53Q96M91 514 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB17-209ENST00000466244 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 PROM2Q8N271 834 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 ITGB4P16144 1822 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 LY75O60449 1722 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 HMOX1P09601 288 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 DCAF5Q96JK2 942 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 NUDCQ9Y266 331 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 PAPPAQ13219 1627 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB17-209ENST00000466244 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 FCHSD2O94868 740 aa20.2■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 MRC1P22897 1456 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 TXNRD1Q16881 649 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 PIGBQ92521 554 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 PRKAR2BP31323 418 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB17-209ENST00000466244 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 PALLDQ8WX93 1383 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 MAP3K5Q99683 1374 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 LGR6Q9HBX8 967 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 ATG3Q9NT62 314 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB17-209ENST00000466244 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.07■□□□□ 0.8
RAB17-209ENST00000466244 NBPF14Q5TI25 921 aa20.07■□□□□ 0.8
RAB17-209ENST00000466244 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.07■□□□□ 0.8
RAB17-209ENST00000466244 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.07■□□□□ 0.8
RAB17-209ENST00000466244 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.07■□□□□ 0.8
RAB17-209ENST00000466244 C5P01031 1676 aa20.07■□□□□ 0.8
RAB17-209ENST00000466244 CASZ1Q86V15 1759 aa20.06■□□□□ 0.8
RAB17-209ENST00000466244 CABP4P57796 275 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms