RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EYA1Q99502 592 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SBF2Q86WG5 1849 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLSCR1O15162 318 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNQ2O43526 872 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NBPF14Q5TI25 921 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPG7Q9UQ90 795 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NHSQ6T4R5 1651 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCAPD2Q15021 1401 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTHFSP49914 203 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RREB1Q92766 1687 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TXNRD1Q16881 649 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP27B1O15528 508 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL13P35225 146 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PROM2Q8N271 834 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BTAF1O14981 1849 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STK32BQ9NY57 414 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFAP53Q96M91 514 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PHKG2P15735 406 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KDRP35968 1356 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HMOX1P09601 288 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC15A2Q16348 729 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP2R1AP30153 589 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF5Q96JK2 942 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUDCQ9Y266 331 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIGBQ92521 554 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PALLDQ8WX93 1383 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRP5O75197 1615 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNQ4P56696 695 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CABP4P57796 275 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPON1Q9HCB6 807 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF827Q17R98 1081 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITGB4P16144 1822 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAPPAQ13219 1627 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LY75O60449 1722 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AKT1S1Q96B36 256 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RALBP1Q15311 655 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBTB7AO95365 584 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIK1P57059 783 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATG3Q9NT62 314 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRKAR2BP31323 418 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTFR1LQ9H019 292 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CASZ1Q86V15 1759 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP6V1AP38606 617 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AK7Q96M32 723 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MSH5O43196 834 aa26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms