RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 MEGF6O75095 1541 aa28.88■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.86■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 TXNRD1Q16881 649 aa28.84■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 POLKQ9UBT6 870 aa28.84■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 BTAF1O14981 1849 aa28.84■■■□□ 2.21
LTB-211ENST00000446745 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.82■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.81■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 MORC1Q86VD1 984 aa28.81■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.8■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.8■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 PROM2Q8N271 834 aa28.79■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.78■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 STK32BQ9NY57 414 aa28.78■■■□□ 2.2
LTB-211ENST00000446745 NCAPD2Q15021 1401 aa28.76■■■□□ 2.19
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LTB-211ENST00000446745 SPG7Q9UQ90 795 aa28.73■■■□□ 2.19
LTB-211ENST00000446745 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.72■■■□□ 2.19
LTB-211ENST00000446745 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.72■■■□□ 2.19
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LTB-211ENST00000446745 SPON1Q9HCB6 807 aa28.71■■■□□ 2.19
LTB-211ENST00000446745 SLC15A2Q16348 729 aa28.7■■■□□ 2.18
LTB-211ENST00000446745 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
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LTB-211ENST00000446745 CYP27B1O15528 508 aa28.65■■■□□ 2.18
LTB-211ENST00000446745 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
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LTB-211ENST00000446745 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.64■■■□□ 2.17
LTB-211ENST00000446745 LY75O60449 1722 aa28.62■■■□□ 2.17
LTB-211ENST00000446745 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.61■■■□□ 2.17
LTB-211ENST00000446745 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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LTB-211ENST00000446745 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LTB-211ENST00000446745 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.59■■■□□ 2.17
LTB-211ENST00000446745 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
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LTB-211ENST00000446745 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.56■■■□□ 2.16
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LTB-211ENST00000446745 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
LTB-211ENST00000446745 MTFR1LQ9H019 292 aa28.55■■■□□ 2.16
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LTB-211ENST00000446745 KCNQ4P56696 695 aa28.5■■■□□ 2.15
LTB-211ENST00000446745 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.5■■■□□ 2.15
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LTB-211ENST00000446745 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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LTB-211ENST00000446745 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.47■■■□□ 2.15
LTB-211ENST00000446745 DCAF5Q96JK2 942 aa28.47■■■□□ 2.15
LTB-211ENST00000446745 C5P01031 1676 aa28.47■■■□□ 2.15
LTB-211ENST00000446745 KDRP35968 1356 aa28.47■■■□□ 2.15
LTB-211ENST00000446745 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.46■■■□□ 2.15
LTB-211ENST00000446745 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.45■■■□□ 2.14
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LTB-211ENST00000446745 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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LTB-211ENST00000446745 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.43■■■□□ 2.14
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LTB-211ENST00000446745 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.42■■■□□ 2.14
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LTB-211ENST00000446745 CABP4P57796 275 aa28.38■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 AK7Q96M32 723 aa28.38■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 ARXQ96QS3 562 aa28.38■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 CFAP53Q96M91 514 aa28.37■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.37■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.37■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 C4BP0C0L5 1744 aa28.36■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 HMOX1P09601 288 aa28.35■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.34■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 ATG3Q9NT62 314 aa28.34■■■□□ 2.13
LTB-211ENST00000446745 ATP6V1AP38606 617 aa28.33■■■□□ 2.13
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