RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
ODC1-204ENST00000446285 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
ODC1-204ENST00000446285 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.78■■■■□ 3.48
ODC1-204ENST00000446285 STK32BQ9NY57 414 aa36.75■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.74■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.74■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 DOT1LQ8TEK3 1739 aa36.73■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 PANK3Q9H999 370 aa36.73■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 SPON1Q9HCB6 807 aa36.73■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 NSD2O96028 1365 aa36.73■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 CASZ1Q86V15 1759 aa36.73■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
ODC1-204ENST00000446285 NCAPD2Q15021 1401 aa36.69■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 SLC15A2Q16348 729 aa36.69■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 PAPPAQ13219 1627 aa36.68■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 POLKQ9UBT6 870 aa36.68■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.67■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.67■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.65■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
ODC1-204ENST00000446285 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.62■■■■□ 3.45
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
ODC1-204ENST00000446285 LY75O60449 1722 aa36.59■■■■□ 3.45
ODC1-204ENST00000446285 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 EYA1Q99502 592 aa36.57■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 KNSTRNQ9Y448 316 aa36.57■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.56■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 LRRC4BQ9NT99 713 aa36.56■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.448e-9■■□□□ 13.5
ODC1-204ENST00000446285 SPG7Q9UQ90 795 aa36.54■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.54■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 QSER1Q2KHR3 1735 aa36.53■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 CYP27B1O15528 508 aa36.52■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 MORC1Q86VD1 984 aa36.52■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB7AO95365 584 aa36.51■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 MTFR1LQ9H019 292 aa36.51■■■■□ 3.44
ODC1-204ENST00000446285 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 ZNF827Q17R98 1081 aa36.49■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 AKT1S1Q96B36 256 aa36.49■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.45■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.45■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 ITGB4P16144 1822 aa36.45■■■■□ 3.43
ODC1-204ENST00000446285 PTGER2P43116 358 aa36.44■■■■□ 3.42
ODC1-204ENST00000446285 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
ODC1-204ENST00000446285 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
ODC1-204ENST00000446285 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.41■■■■□ 3.42
ODC1-204ENST00000446285 SLC16A10Q8TF71 515 aa36.41■■■■□ 3.42
ODC1-204ENST00000446285 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.4■■■■□ 3.42
ODC1-204ENST00000446285 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
ODC1-204ENST00000446285 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa36.38■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa36.38■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 PALLDQ8WX93 1383 aa36.38■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 PHKG2P15735 406 aa36.36■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 KCNQ4P56696 695 aa36.36■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 SGIP1Q9BQI5 828 aa36.36■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 C5P01031 1676 aa36.35■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa36.34■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.34■■■■□ 3.41
ODC1-204ENST00000446285 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 TAF1LQ8IZX4 1826 aa36.31■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 PIGBQ92521 554 aa36.31■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 COL24A1Q17RW2 1714 aa36.31■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.3■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.3■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 ARXQ96QS3 562 aa36.28■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.27■■■■□ 3.4
ODC1-204ENST00000446285 KDRP35968 1356 aa36.26■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 POLD1P28340 1107 aa36.25■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 IL13P35225 146 aa36.25■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 MAP3K5Q99683 1374 aa36.25■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 FLAD1Q8NFF5 587 aa36.23■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 DCAF5Q96JK2 942 aa36.23■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.22■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 SYT17Q9BSW7 474 aa36.22■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 C4BP0C0L5 1744 aa36.22■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 MTHFSP49914 203 aa36.21■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.21■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.2■■■■□ 3.39
ODC1-204ENST00000446285 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.19■■■■□ 3.38
ODC1-204ENST00000446285 SIK1P57059 783 aa36.19■■■■□ 3.38
ODC1-204ENST00000446285 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
ODC1-204ENST00000446285 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.16■■■■□ 3.38
ODC1-204ENST00000446285 AK7Q96M32 723 aa36.16■■■■□ 3.38
ODC1-204ENST00000446285 MSH5O43196 834 aa36.15■■■■□ 3.38
ODC1-204ENST00000446285 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.15■■■■□ 3.38
ODC1-204ENST00000446285 ATG3Q9NT62 314 aa36.13■■■■□ 3.37
ODC1-204ENST00000446285 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
ODC1-204ENST00000446285 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.12■■■■□ 3.37
ODC1-204ENST00000446285 ZNF831Q5JPB2 1677 aa36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms