RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445489.1

FARP2-208, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 2, human

TSL 2

Gene FARP2, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP2-208	ENST00000445489		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	ERBB3	P21860	1342 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	CHL1	O00533	1208 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	ABCC6	O95255	1503 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
FARP2-208	ENST00000445489	FAM83G	A6ND36	823 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	BCAR3	O75815	825 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2	2e-7	■■□□□ 13.2
FARP2-208	ENST00000445489	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	KIAA0232	Q92628	1395 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	PLIN1	O60240	522 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	MS4A1	P11836	297 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	MCM10	Q7L590	875 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	CRB1	P82279	1406 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	VAMP4	O75379	141 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	AAMP	Q13685	434 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FARP2-208	ENST00000445489	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	EVA1C	P58658	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	LRP6	O75581	1613 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	LTN1	O94822	1766 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	TEF	Q10587	303 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	COL18A1	P39060	1754 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	PHKG2	P15735	406 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FARP2-208	ENST00000445489	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FARP2-208	ENST00000445489	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FARP2-208	ENST00000445489	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FARP2-208	ENST00000445489	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FARP2-208	ENST00000445489	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FARP2-208	ENST00000445489	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FARP2-208	ENST00000445489	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FARP2-208	ENST00000445489	HOXB7	P09629	217 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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