RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 NSD2O96028 1365 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4-205ENST00000444916 UTRNP46939 3433 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4-205ENST00000444916 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4-205ENST00000444916 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4-205ENST00000444916 TXNRD1Q16881 649 aa19.41■□□□□ 0.7
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
SH3BP4-205ENST00000444916 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.4■□□□□ 0.7
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF4Q96M43 638 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 POLKQ9UBT6 870 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 MEGF6O75095 1541 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 STK32BQ9NY57 414 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC15A2Q16348 729 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 SYT17Q9BSW7 474 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 NHSQ6T4R5 1651 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 MORC1Q86VD1 984 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 SGIP1Q9BQI5 828 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 NCAPD2Q15021 1401 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.33■□□□□ 0.69
SH3BP4-205ENST00000444916 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 ACSBG1Q96GR2 724 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 MTFR1LQ9H019 292 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 BTAF1O14981 1849 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 CHD4Q14839 1912 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 ARXQ96QS3 562 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 EYA1Q99502 592 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 PAPPAQ13219 1627 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF827Q17R98 1081 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 C1QTNF8P60827 252 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 IGSF1Q8N6C5 1336 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K5Q99683 1374 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP27B1O15528 508 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR162Q16538 588 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 KLHL34Q8N239 644 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 SPG7Q9UQ90 795 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 MTHFSP49914 203 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNQ4P56696 695 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 AKT1S1Q96B36 256 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 IL13P35225 146 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP350Q5VT06 3117 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 LY75O60449 1722 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGB4P16144 1822 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 KDRP35968 1356 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-205ENST00000444916 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 PHKG2P15735 406 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 POLD1P28340 1107 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-205ENST00000444916 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 PIGBQ92521 554 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 PALLDQ8WX93 1383 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TMOD3Q9NYL9 352 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 HMOX1P09601 288 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms