RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439930.7

PCBP2-204, Transcript of poly(rC) binding protein 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCBP2, Length 1,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2-204ENST00000439930 MTHFSP49914 203 aa14.8□□□□□ -0.04
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PCBP2-204ENST00000439930 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP2-204ENST00000439930 NCAPD2Q15021 1401 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP2-204ENST00000439930 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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PCBP2-204ENST00000439930 IL13P35225 146 aa14.75□□□□□ -0.05
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PCBP2-204ENST00000439930 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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PCBP2-204ENST00000439930 CYP27B1O15528 508 aa14.72□□□□□ -0.05
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PCBP2-204ENST00000439930 PPP2R1AP30153 589 aa14.72□□□□□ -0.05
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PCBP2-204ENST00000439930 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.69□□□□□ -0.06
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PCBP2-204ENST00000439930 PHKG2P15735 406 aa14.67□□□□□ -0.06
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PCBP2-204ENST00000439930 KDRP35968 1356 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP2-204ENST00000439930 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP2-204ENST00000439930 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PCBP2-204ENST00000439930 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.66□□□□□ -0.06
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PCBP2-204ENST00000439930 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.62□□□□□ -0.07
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PCBP2-204ENST00000439930 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
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PCBP2-204ENST00000439930 NBPF14Q5TI25 921 aa14.62□□□□□ -0.07
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PCBP2-204ENST00000439930 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.61□□□□□ -0.07
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PCBP2-204ENST00000439930 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.6□□□□□ -0.07
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PCBP2-204ENST00000439930 LY75O60449 1722 aa14.58□□□□□ -0.08
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PCBP2-204ENST00000439930 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.57□□□□□ -0.08
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PCBP2-204ENST00000439930 SLC15A2Q16348 729 aa14.54□□□□□ -0.08
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PCBP2-204ENST00000439930 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCBP2-204ENST00000439930 ATG3Q9NT62 314 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP2-204ENST00000439930 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.53□□□□□ -0.08
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PCBP2-204ENST00000439930 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.52□□□□□ -0.09
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PCBP2-204ENST00000439930 SIK1P57059 783 aa14.52□□□□□ -0.09
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