RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434451.1

TNS3-205, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TNS3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-205ENST00000434451 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.88■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 CASZ1Q86V15 1759 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 TXNRD1Q16881 649 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 PAPPAQ13219 1627 aa22.86■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 PROM2Q8N271 834 aa22.86■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.84■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 POLKQ9UBT6 870 aa22.83■■□□□ 1.25
TNS3-205ENST00000434451 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.82■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.82■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.81■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 LY75O60449 1722 aa22.81■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 STK32BQ9NY57 414 aa22.79■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.78■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.77■■□□□ 1.24
TNS3-205ENST00000434451 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 SLC15A2Q16348 729 aa22.76■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.76■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.76■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 EYA1Q99502 592 aa22.75■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 SPON1Q9HCB6 807 aa22.75■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 MORC1Q86VD1 984 aa22.74■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.238e-11■□□□□ 10.7
TNS3-205ENST00000434451 ITGB4P16144 1822 aa22.73■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 CYP27B1O15528 508 aa22.72■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 SPG7Q9UQ90 795 aa22.72■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.72■■□□□ 1.23
TNS3-205ENST00000434451 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.7■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.68■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 C5P01031 1676 aa22.67■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.66■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 ZNF827Q17R98 1081 aa22.66■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 AKT1S1Q96B36 256 aa22.66■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.65■■□□□ 1.22
TNS3-205ENST00000434451 MTFR1LQ9H019 292 aa22.64■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.63■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 ZBTB7AO95365 584 aa22.63■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.63■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 PALLDQ8WX93 1383 aa22.63■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 PHKG2P15735 406 aa22.62■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 KDRP35968 1356 aa22.62■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 PTGER2P43116 358 aa22.61■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.61■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 IL13P35225 146 aa22.58■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.58■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.58■■□□□ 1.21
TNS3-205ENST00000434451 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.57■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 KCNQ4P56696 695 aa22.57■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 PIGBQ92521 554 aa22.57■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.57■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.57■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.56■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 C4BP0C0L5 1744 aa22.56■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 MTHFSP49914 203 aa22.55■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.55■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.54■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 DCAF5Q96JK2 942 aa22.54■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.53■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.52■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.52■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TNS3-205ENST00000434451 MAP3K5Q99683 1374 aa22.51■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.51■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.49■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 SIK1P57059 783 aa22.49■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.49■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.49■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 ARXQ96QS3 562 aa22.48■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 POLD1P28340 1107 aa22.47■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.47■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 ATG3Q9NT62 314 aa22.46■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms