RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424529.6

VGLL4-208, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL4, Length 1,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-208ENST00000424529 TRIM37O94972 964 aa29.13■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 KDRP35968 1356 aa29.13■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.12■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.09■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.09■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
VGLL4-208ENST00000424529 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.07■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 CYP27B1O15528 508 aa29.05■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 NHSQ6T4R5 1651 aa29.04■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 KCNQ2O43526 872 aa29.03■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 RALBP1Q15311 655 aa29.03■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.03■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.02■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.02■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.02■■■□□ 2.24
VGLL4-208ENST00000424529 BAG6P46379 1132 aa29.01■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 APBA3O96018 575 aa29■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 SPG7Q9UQ90 795 aa29■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 PLSCR1O15162 318 aa28.97■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.97■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 CFAP53Q96M91 514 aa28.97■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.96■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.95■■■□□ 2.23
VGLL4-208ENST00000424529 PHKG2P15735 406 aa28.95■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 HMOX1P09601 288 aa28.93■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.93■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.93■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.92■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 RREB1Q92766 1687 aa28.92■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 PROM2Q8N271 834 aa28.91■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 BTAF1O14981 1849 aa28.9■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
VGLL4-208ENST00000424529 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.88■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 NUDCQ9Y266 331 aa28.87■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.84■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 ITGB4P16144 1822 aa28.83■■■□□ 2.21
VGLL4-208ENST00000424529 FCHSD2O94868 740 aa28.82■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 DCAF5Q96JK2 942 aa28.81■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 TXNRD1Q16881 649 aa28.8■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.8■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.8■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.8■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 PRKAR2BP31323 418 aa28.79■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 PIGBQ92521 554 aa28.79■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.79■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.78■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 LY75O60449 1722 aa28.77■■■□□ 2.2
VGLL4-208ENST00000424529 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.76■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.76■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.75■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 PAPPAQ13219 1627 aa28.74■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.74■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.74■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 LGR6Q9HBX8 967 aa28.72■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.71■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.71■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 MRC1P22897 1456 aa28.71■■■□□ 2.19
VGLL4-208ENST00000424529 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.7■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 PALLDQ8WX93 1383 aa28.68■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 ATG3Q9NT62 314 aa28.68■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 MAP3K5Q99683 1374 aa28.67■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 IL17REQ8NFR9 667 aa28.67■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.67■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.65■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 CABP4P57796 275 aa28.65■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 CCDC184Q52MB2 194 aa28.65■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.65■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.64■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 NBPF14Q5TI25 921 aa28.64■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.64■■■□□ 2.18
VGLL4-208ENST00000424529 KCNQ4P56696 695 aa28.63■■■□□ 2.17
VGLL4-208ENST00000424529 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
VGLL4-208ENST00000424529 ANP32CO43423 234 aa28.62■■■□□ 2.17
VGLL4-208ENST00000424529 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
VGLL4-208ENST00000424529 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms