RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NEFMP07197 916 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RUNDC1Q96C34 613 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PKD1L3Q7Z443 1732 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AMOTQ4VCS5 1084 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPG7Q9UQ90 795 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TNS2Q63HR2 1409 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LRRC37A3O60309 1634 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RXRBP28702 533 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POTEAQ6S8J7 498 aa17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EXOC5O00471 708 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NFE2L2Q16236 605 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DDB1Q16531 1140 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 A0A0G2JS52 829 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 APAF1O14727 1248 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYT1Q01538 1121 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NGEFQ8N5V2 710 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAP3K5Q99683 1374 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CYP27B1O15528 508 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PHKG2P15735 406 aa17.7■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.69■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GNAT3A8MTJ3 354 aa17.69■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.69■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RGS12O14924 1447 aa17.69■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RIPK4P57078 832 aa17.68■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PDE3BQ13370 1112 aa17.68■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC27Q2M243 656 aa17.67■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.67■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.66■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NEUROD2Q15784 382 aa17.66■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCAF5Q96JK2 942 aa17.66■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BCL9O00512 1426 aa17.65■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.65■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.65■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa17.65■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SCN11AQ9UI33 1791 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RNMTO43148 476 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WWC1Q8IX03 1113 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IL17REQ8NFR9 667 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MRC1P22897 1456 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MCM10Q7L590 875 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF521Q96K83 1311 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ERVV-2B6SEH9 535 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCTN1Q14203 1278 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LGR6Q9HBX8 967 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DOT1LQ8TEK3 1739 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.59■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TEFQ10587 303 aa17.58■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM196AQ6ZSG2 479 aa17.58■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WDR63Q8IWG1 891 aa17.58■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IL16Q14005 1332 aa17.57■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC52A2Q9HAB3 445 aa17.57■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NHSQ6T4R5 1651 aa17.56■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CABP4P57796 275 aa17.56■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM182BQ5T319 152 aa17.56■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ITGB4P16144 1822 aa17.56■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMOD3Q9NYL9 352 aa17.55■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SBF2Q86WG5 1849 aa17.55■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IFT57Q9NWB7 429 aa17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms