RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420195.1

SH3BP5-AS1-202, SH3BP5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5-AS1, Length 5,570 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 RLBP1P12271 317 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 TSPY26PQ9H489 355 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 GUCY1B3Q02153 619 aa10.67□□□□□ -0.7
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SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 ME1P48163 572 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 MCM2P49736 904 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 STK38Q15208 465 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 KCNH5Q8NCM2 988 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.66□□□□□ -0.7
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SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.65□□□□□ -0.7
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