RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PLSCR1O15162 318 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MTHFSP49914 203 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BP4-204ENST00000416021 NCAPD2Q15021 1401 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IL13P35225 146 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SPG7Q9UQ90 795 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PROM2Q8N271 834 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP27B1O15528 508 aa28.56■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF14Q5TI25 921 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SBF2Q86WG5 1849 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP4-204ENST00000416021 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNRD1Q16881 649 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.48■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PHKG2P15735 406 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R1AP30153 589 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NHSQ6T4R5 1651 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 HMOX1P09601 288 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP53Q96M91 514 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KDRP35968 1356 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.39■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGBQ92521 554 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 RREB1Q92766 1687 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 STK32BQ9NY57 414 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF5Q96JK2 942 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNQ4P56696 695 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC15A2Q16348 729 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDCQ9Y266 331 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 BTAF1O14981 1849 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.31■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RALBP1Q15311 655 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.27■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 CABP4P57796 275 aa28.27■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 PALLDQ8WX93 1383 aa28.26■■■□□ 2.12
SH3BP4-204ENST00000416021 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF827Q17R98 1081 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 AKT1S1Q96B36 256 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ATG3Q9NT62 314 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 LGR6Q9HBX8 967 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 FCHSD2O94868 740 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKAR2BP31323 418 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SIK1P57059 783 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SPON1Q9HCB6 807 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB7AO95365 584 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V1AP38606 617 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGB4P16144 1822 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.14■■■□□ 2.1
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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