RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398333.7

C15orf38-AP3S2-201, Transcript of C15orf38-AP3S2 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C15orf38-AP3S2, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TSPYL6Q8N831 410 aa20.67■□□□□ 0.9
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 BRD1O95696 1058 aa20.54■□□□□ 0.88
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SLIT1O75093 1534 aa20.48■□□□□ 0.87
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MCM2P49736 904 aa20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RTL1A6NKG5 1358 aa20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NEK4P51957 841 aa20.46■□□□□ 0.87
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ARID3AQ99856 593 aa20.46■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.46■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.46■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TCHHQ07283 1943 aa20.46■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 IL13P35225 146 aa20.46■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.46■□□□□ 0.87
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 UVSSAQ2YD98 709 aa20.45■□□□□ 0.86
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DMTNQ08495 405 aa20.45■□□□□ 0.86
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